RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317620.13

PROM2-201, Transcript of prominin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PROM2, Length 4,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2-201ENST00000317620 RMDN3Q96TC7 470 aa14.72□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 COX16Q9P0S2 106 aa14.72□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.72□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 K7ERI5 159 aa14.72□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 ATF2P15336 505 aa14.72□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 OSTNP61366 133 aa14.72□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 GABPAQ06546 454 aa14.72□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 Q3C1V9 767 aa14.72□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 HAUS1Q96CS2 278 aa14.72□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.72□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 BARHL2Q9NY43 387 aa14.72□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.72□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 E9PMD0 336 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 MFAP3LO75121 409 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 CSF1RP07333 972 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 KIF22Q14807 665 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 ATP2A3Q93084 1043 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 RNF40O75150 1001 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 SERPING1P05155 500 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 SLC12A2P55011 1212 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 KIF28PB7ZC32 967 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 GUCY1A2P33402 732 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 C12orf60Q5U649 245 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.71□□□□□ -0.05
PROM2-201ENST00000317620 PP2D1A8MPX8 630 aa14.71□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 AKR1B1P15121 316 aa14.71□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 ARHGAP25P42331 645 aa14.71□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 PRCPP42785 496 aa14.71□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 NEDD9Q14511 834 aa14.71□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 ZBTB33Q86T24 672 aa14.71□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.71□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 SP8Q8IXZ3 490 aa14.71□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 MED4Q9NPJ6 270 aa14.71□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.71□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 H7C0C1 242 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 CIB2O75838 187 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 ATP5OP48047 213 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 ZSCAN26Q16670 478 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 CPS1P31327 1500 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 PHBP35232 272 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 POTEDQ86YR6 584 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 ZNF609O15014 1411 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 CAMTA2O94983 1202 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 SPP2Q13103 211 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 KCTD16Q68DU8 428 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 SFR1Q86XK3 245 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 NME8Q8N427 588 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 TRIM11Q96F44 468 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 MTMR1Q13613 665 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 SHC4Q6S5L8 630 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 FAM20AQ96MK3 541 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.7□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 POTEB3A0JP26 581 aa14.69□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 CCDC160A6NGH7 325 aa14.69□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 POTECB2RU33 542 aa14.69□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 ZBTB7AO95365 584 aa14.69□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 PRR29P0C7W0 189 aa14.69□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 POTEBQ6S5H4 581 aa14.69□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.69□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.69□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PROM2-201ENST00000317620 FAM81BQ96LP2 452 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms