RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
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HCLS1-201ENST00000314583 SYT17Q9BSW7 474 aa20.48■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 NDST4Q9H3R1 872 aa20.48■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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HCLS1-201ENST00000314583 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 MEIS1O00470 390 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 GAS7O60861 476 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 KLRG1Q96E93 195 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.47■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.47■□□□□ 0.87
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HCLS1-201ENST00000314583 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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HCLS1-201ENST00000314583 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.46■□□□□ 0.87
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HCLS1-201ENST00000314583 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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HCLS1-201ENST00000314583 NEK9Q8TD19 979 aa20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.46■□□□□ 0.87
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HCLS1-201ENST00000314583 C12orf42Q96LP6 360 aa20.46■□□□□ 0.87
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HCLS1-201ENST00000314583 REEP2Q9BRK0 252 aa20.46■□□□□ 0.87
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HCLS1-201ENST00000314583 PICK1Q9NRD5 415 aa20.46■□□□□ 0.87
HCLS1-201ENST00000314583 RNF181Q9P0P0 153 aa20.46■□□□□ 0.87
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HCLS1-201ENST00000314583 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.44■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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HCLS1-201ENST00000314583 FLOT1O75955 427 aa20.44■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 UBXN2AP68543 259 aa20.44■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 CDK17Q00537 523 aa20.44■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.44■□□□□ 0.86
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HCLS1-201ENST00000314583 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 SFR1Q86XK3 245 aa20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 RGL1Q9NZL6 768 aa20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 KCND2Q9NZV8 630 aa20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 ALAS1P13196 640 aa20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HCLS1-201ENST00000314583 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.43■□□□□ 0.86
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