RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 KDM4CQ9H3R0 1056 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 F8W031 263 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMTC3Q6ZXV5 915 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 IFT74Q96LB3 600 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 ITIH3Q06033 890 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC29A2Q14542 456 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 LMNTD2Q8IXW0 634 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 METTL13Q8N6R0 699 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKS1AQ92625 1134 aa16.04■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAD23BP54727 409 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 ETAA1Q9NY74 926 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLRC4O43908 158 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACSL3O95573 720 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 SERPING1P05155 500 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT16P08779 473 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 VPS41P49754 854 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSPOAP1O95153 1857 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPIP5K2O43314 1243 aa16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 GNAT2P19087 354 aa16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 RWDD2BP57060 319 aa16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 MUM1Q2TAK8 710 aa16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEK9Q8TD19 979 aa16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 GJA10Q969M2 543 aa16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 MKNK2Q9HBH9 465 aa16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1-201ENST00000300213 SUN1O94901 812 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 NAB2Q15742 525 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRIG3Q6UXM1 1119 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRP10Q7Z4F1 713 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD302Q8IX05 232 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM129AQ9BZQ8 928 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC169A6NNP5 214 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 CYP2D6P10635 497 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 GYG1P46976 350 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM4Q9C037 500 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABCC12Q96J65 1359 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 SEMA3FQ13275 785 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 F8VZ95 297 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 CALM1P0DP23 149 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 CALM2P0DP24 149 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 CALM3P0DP25 149 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 RUBCNQ92622 972 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 INTUQ9ULD6 942 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 PMS2P54278 862 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 TROAPQ12815 778 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 CEP120Q8N960 986 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 SNX29Q8TEQ0 813 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZFATQ9P243 1243 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 POTEMA6NI47 508 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 OR52Z1P0C646 297 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 STX2P32856 288 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 MSH2P43246 934 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADCY2Q08462 1091 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 GRIK3Q13003 919 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNIP1Q15025 636 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 VPS36Q86VN1 386 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 C3orf20Q8ND61 904 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 20.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 TBX22Q9Y458 520 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 HEG1Q9ULI3 1381 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 GBP1P32455 592 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 CTSWP56202 376 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 DR1Q01658 176 aa16■□□□□ 0.15
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC18A3Q16572 532 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms