RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 EYA4O95677 639 aa25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 RMDN3Q96TC7 470 aa25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 REEP2Q9BRK0 252 aa25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 KCND1Q9NSA2 647 aa25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 LGALS16A8MUM7 142 aa25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB39O15060 712 aa25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 KCNJ6P48051 423 aa25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 RIT2Q99578 217 aa25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 JADE2Q9NQC1 790 aa25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 GYPCP04921 128 aa25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 OAZ1P54368 228 aa25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 PXMP2Q9NR77 195 aa25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 CASP14P31944 242 aa25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 MB21D1Q8N884 522 aa25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 B4DLN1 442 aa25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC63Q05C16 580 aa25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 MTMR1Q13613 665 aa25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 EPHA7Q15375 998 aa25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 POLD4Q9HCU8 107 aa25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 CSADQ9Y600 493 aa25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 TREML2Q5T2D2 321 aa25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD17Q8N5Z5 321 aa25.27■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.26■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 RSPH10BP0C881 870 aa25.26■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 TNNT1P13805 278 aa25.26■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.26■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.26■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.26■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 MFAP3LO75121 409 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 ATP2A1O14983 1001 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP6O43182 974 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 STX10O60499 249 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 CASP5P51878 434 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 PLS1Q14651 629 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 SFR1Q86XK3 245 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 BANK1Q8NDB2 785 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 PANX2Q96RD6 677 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 TSG101Q99816 390 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 WDR90Q96KV7 1748 aa25.25■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 MIIPQ5JXC2 388 aa25.24■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.24■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 NYAP1Q6ZVC0 841 aa25.24■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 MOB2Q70IA6 237 aa25.24■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 LXNQ9BS40 222 aa25.24■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 ELP3Q9H9T3 547 aa25.24■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 EPHX2P34913 555 aa25.24■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.23■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 DNM2P50570 870 aa25.23■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.23■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 CDCA5Q96FF9 252 aa25.23■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.23■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 NACC1Q96RE7 527 aa25.23■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 OTOFQ9HC10 1997 aa25.23■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 MYPNQ86TC9 1320 aa25.23■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PQC6 194 aa25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 MUTP22033 750 aa25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN14Q15678 1187 aa25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 PEX10O60683 326 aa25.22■■□□□ 1.63
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