RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 KAT6AQ92794 2004 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 MARCH6O60337 910 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ASGR1P07306 291 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PRPHP41219 470 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ACLYP53396 1101 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ACTR2P61160 394 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 RDM1Q8NG50 284 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 EMSYQ7Z589 1322 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 WDR64B1ANS9 1081 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 LGR5O75473 907 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 CABYRO75952 493 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 F2P00734 622 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 LGALS2P05162 132 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 COL6A1P12109 1028 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 SFNP31947 248 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 JAK3P52333 1124 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 SP4Q02446 784 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PTPAQ15257 358 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ATL3Q6DD88 541 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 USP28Q96RU2 1077 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 TXKP42681 527 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 SOX10P56693 466 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 DISC1Q9NRI5 854 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 CLIC4Q9Y696 253 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ALPK3Q96L96 1907 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PQY0 241 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 MYL3P08590 195 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 KAT2BQ92831 832 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PCYT2Q99447 389 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 HAS3O00219 553 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 EML1O00423 815 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 CHMP2AO43633 222 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PSAPP07602 524 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF286BP0CG31 522 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 SAMM50Q9Y512 469 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 POTEMA6NI47 508 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 H3BRB1 525 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 YEATS4O95619 227 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 TECP42680 631 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SLC26A2P50443 739 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 STAT5BP51692 787 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 PDIA5Q14554 519 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 SLC39A14Q15043 492 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 EPHA7Q15375 998 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 IL17AQ16552 155 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM50Q86XT4 487 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 FERMT2Q96AC1 680 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 RAB34Q9BZG1 259 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC42-201ENST00000293845 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms