RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293068.9

IKZF3-201, Transcript of IKAROS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IKZF3, Length 2,224 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF3-201ENST00000293068 ARSHQ5FYA8 562 aa11.88□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 ERO1BQ86YB8 467 aa11.88□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CREBRFQ8IUR6 639 aa11.88□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TPH2Q8IWU9 490 aa11.88□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.88□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.88□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 VPS16Q9H269 839 aa11.88□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.88□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 ACAD9Q9H845 621 aa11.88□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 GRIN3BO60391 1043 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 KCNJ6P48051 423 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 MTMR1Q13613 665 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 GIT2Q14161 759 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PTPN21Q16825 1174 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PPFIBP1Q86W92 1011 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 NACC1Q96RE7 527 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 KCND1Q9NSA2 647 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TBC1D22BQ9NU19 505 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 WDR90Q96KV7 1748 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 IQCA1LA6NCM1 817 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CXCL11O14625 94 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CCND2P30279 289 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TMX1Q9H3N1 280 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 ELP3Q9H9T3 547 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.87□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 LGALS16A8MUM7 142 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TPM1P09493 284 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TRIM14Q14142 442 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PLS1Q14651 629 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 MIER3Q7Z3K6 550 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 MB21D1Q8N884 522 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CHST13Q8NET6 341 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 DHX15O43143 795 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 GAP43P17677 238 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 UBXN1Q04323 297 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 LRRC41Q15345 812 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TREML2Q5T2D2 321 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 NLRX1Q86UT6 975 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 VSIG10LQ86VR7 867 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 REEP2Q9BRK0 252 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 KCND2Q9NZV8 630 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.86□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 OTOFQ9HC10 1997 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 A0A1W2PQC6 194 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 MAFGO15525 162 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 P4HBP07237 508 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 NR3C2P08235 984 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 DNM2P50570 870 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 LBX2Q6XYB7 198 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TC2NQ8N9U0 490 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 GPRASP2Q96D09 838 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 OTUD5Q96G74 571 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PANX2Q96RD6 677 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CYP39A1Q9NYL5 469 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.85□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 IRF6O14896 467 aa11.84□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CCP110O43303 1012 aa11.84□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 STAM2O75886 525 aa11.84□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 PPIL2Q13356 520 aa11.84□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CNGA4Q8IV77 575 aa11.84□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
IKZF3-201ENST00000293068 CCDC51Q96ER9 411 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms