RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MECOMQ03112 1051 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 RASIP1Q5U651 963 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MT-ND3P03897 115 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 UNC13DQ70J99 1090 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB2P05120 415 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MXD3Q9BW11 206 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ANO9A1A5B4 782 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 BAG6P46379 1132 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 HDAC11Q96DB2 347 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 NCAPD2Q15021 1401 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS16A8MUM7 142 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8SH3BPF8 625 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MCAMP43121 646 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 SESTD1Q86VW0 696 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 LRGUKQ96M69 825 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.84■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 TTC4O95801 387 aa22.83■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 IGBP1P78318 339 aa22.83■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ADCY2Q08462 1091 aa22.83■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 RCN2Q14257 317 aa22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 KSR1Q8IVT5 923 aa22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 CDK8P49336 464 aa22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 BBS5Q8N3I7 341 aa22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 GDF11O95390 407 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SURF1Q15526 300 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 FAM160B2Q86V87 743 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 PROM2Q8N271 834 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 BCS1LQ9Y276 419 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L3A6NCW0 530 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L4A6NCW7 530 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ARL4AP40617 200 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 RWDD2BP57060 319 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 RAPH1Q70E73 1250 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 COX16Q9P0S2 106 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 GDAQ9Y2T3 454 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ACTN1P12814 892 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 AP3B2Q13367 1082 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SULF1Q8IWU6 871 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 VGLL3A8MV65 326 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 STX1BP61266 288 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2SQ16763 222 aa22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 CLRN2A0PK11 232 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 PODXLO00592 558 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SLCO1A2P46721 670 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 KDM6BO15054 1643 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 LPXNO60711 386 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 CCND2P30279 289 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ABL1P00519 1130 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 CEP72Q9P209 647 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 THEGQ9P2T0 379 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 CCNA1P78396 465 aa22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 COG7P83436 770 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A5Q01650 507 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ADCY1Q08828 1119 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 ARID5BQ14865 1188 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 MGEA5O60502 916 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.8■■□□□ 1.24
CCSAP-201ENST00000284617 NFU1Q9UMS0 254 aa22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms