RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 YY1AP1Q9H869 796 aa8.59□□□□□ -1.03
LIMD1-201ENST00000273317 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LIMD1-201ENST00000273317 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
LIMD1-201ENST00000273317 ANKRD12Q6UB98 2062 aa8.59□□□□□ -1.03
LIMD1-201ENST00000273317 KRT37O76014 449 aa8.59□□□□□ -1.03
LIMD1-201ENST00000273317 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LIMD1-201ENST00000273317 GUCY2CP25092 1073 aa8.59□□□□□ -1.03
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LIMD1-201ENST00000273317 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
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LIMD1-201ENST00000273317 PODNQ7Z5L7 613 aa8.59□□□□□ -1.03
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LIMD1-201ENST00000273317 ARL4CP56559 192 aa8.59□□□□□ -1.03
LIMD1-201ENST00000273317 C16orf87Q6PH81 154 aa8.59□□□□□ -1.03
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LIMD1-201ENST00000273317 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.59□□□□□ -1.03
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LIMD1-201ENST00000273317 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.58□□□□□ -1.04
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LIMD1-201ENST00000273317 RDH13Q8NBN7 331 aa8.58□□□□□ -1.04
LIMD1-201ENST00000273317 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.58□□□□□ -1.04
LIMD1-201ENST00000273317 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LIMD1-201ENST00000273317 VPS39Q96JC1 886 aa8.58□□□□□ -1.04
LIMD1-201ENST00000273317 FGAP02671 866 aa8.57□□□□□ -1.04
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