RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262315.13

CHTF18-201, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHTF18, Length 3,090 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-201ENST00000262315 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 GJA5P36382 358 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 DNA2P51530 1060 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 ADCY7P51828 1080 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 WDR78Q5VTH9 848 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 PSMA7O14818 248 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 SMARCA1P28370 1054 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 GNA11P29992 359 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 TRAPPC10P48553 1259 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 COG2Q14746 738 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 ADSSL1Q8N142 457 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 RMND1Q9NWS8 449 aa14.74□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 H3BQF6 201 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 ZBED4O75132 1171 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 TDP2O95551 362 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 PPIL2Q13356 520 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 SNAPC2Q13487 334 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 EXOC1Q9NV70 894 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 KIAA1328Q86T90 577 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.73□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 MARCH6O60337 910 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 TUBB4AP04350 444 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 OR52Z1P0C646 297 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 CCL15Q16663 113 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 CDC23Q9UJX2 597 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 NDUFA10O95299 355 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 STIM1Q13586 685 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.051e-6■■■□□ 15.4
CHTF18-201ENST00000262315 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 MB21D1Q8N884 522 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 CUL5Q93034 780 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 POLD4Q9HCU8 107 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 CXCL11O14625 94 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 KLRC4O43908 158 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 FKBP1BP68106 108 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 NSMFQ6X4W1 530 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 TBC1D5Q92609 795 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.72□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 DOCK1Q14185 1865 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 VWA5AO00534 786 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 CYP2C8P10632 490 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 ARHGAP25P42331 645 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 SPAG1Q07617 926 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 SRLQ86TD4 932 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 VPS18Q9P253 973 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-201ENST00000262315 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-201ENST00000262315 SLC37A4O43826 429 aa14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-201ENST00000262315 TOMM70O94826 608 aa14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-201ENST00000262315 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms