RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 GAS7O60861 476 aa24.61■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP2B1P20020 1258 aa24.61■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 TRAPPC10P48553 1259 aa24.61■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 LRCH2Q5VUJ6 765 aa24.61■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 ARVCFO00192 962 aa24.6■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 HAS3O00219 553 aa24.6■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 ATG7O95352 703 aa24.6■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.6■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.6■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.6■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 EMSYQ7Z589 1322 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 H3BRB1 525 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 TBX3O15119 743 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 NEMFO60524 1076 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT76Q01546 638 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 DPF3Q92784 378 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM20AQ96MK3 541 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 PCYT2Q99447 389 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 MCM7P33993 719 aa24.58■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 PSEN2P49810 448 aa24.58■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 TLE2Q04725 743 aa24.58■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 NBR1Q14596 966 aa24.58■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 MFSD10Q14728 455 aa24.58■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 TTC38Q5R3I4 469 aa24.58■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 ABHD15Q6UXT9 468 aa24.58■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 FERMT3Q86UX7 667 aa24.58■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.58■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.58■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 STX6O43752 255 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 EVI5O60447 810 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 LGR5O75473 907 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 CHMP4BP1P59074 171 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 TOX2Q96NM4 488 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 UNC45AQ9H3U1 944 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 MTMR6Q9Y217 621 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 VAV3Q9UKW4 847 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 WDR64B1ANS9 1081 aa24.56■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 CHMP2AO43633 222 aa24.56■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa24.56■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF174Q15697 407 aa24.56■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 CALCRLQ16602 461 aa24.56■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 BRAPQ7Z569 592 aa24.56■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 C7orf61Q8IZ16 206 aa24.56■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 MTMR9Q96QG7 549 aa24.56■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 BECN1Q14457 450 aa24.55■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.55■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.55■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.55■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 GLG1Q92896 1179 aa24.55■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.55■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 DISC1Q9NRI5 854 aa24.55■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.54■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.54■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP2R5CQ13362 524 aa24.54■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa24.54■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 SESTD1Q86VW0 696 aa24.54■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.54■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa24.54■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 CD4P01730 458 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 FAAP100Q0VG06 881 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 RESTQ13127 1097 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 AZI2Q9H6S1 392 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 SAMM50Q9Y512 469 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 MARCH6O60337 910 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 B4GALT4O60513 344 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 MARK3P27448 753 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 SFNP31947 248 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 STAT5BP51692 787 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 JAK3P52333 1124 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 C7orf31Q8N865 590 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC25A39-201ENST00000225308 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.53■■□□□ 1.52
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