RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220429.12

GABPB1-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1, Length 2,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-201ENST00000220429 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 EMBQ6PCB8 327 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.92□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 A0A087X0B3 334 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ABLIM1O14639 778 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ADAMTS3O15072 1205 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 NR1I3Q14994 352 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 Q4G0T1 1027 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 DGKHQ86XP1 1220 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ARL10Q8N8L6 244 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CAGE1Q8TC20 777 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 EPSTI1Q96J88 318 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 MTRQ99707 1265 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 USP17L3A6NCW0 530 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 USP17L4A6NCW7 530 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PSMD14O00487 310 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ALADP13716 330 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ATP2B4P23634 1241 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PLCD1P51178 756 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF174Q15697 407 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PNMA1Q8ND90 353 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ANKS1AQ92625 1134 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 GGA1Q9UJY5 639 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 MYH1P12882 1939 aa14.91□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 LDHCP07864 332 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 IL1R1P14778 569 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF18P17022 549 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 POLE2P56282 527 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 TAF11Q15544 211 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 TTC38Q5R3I4 469 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 RUBCNQ92622 972 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 GALNT8Q9NY28 637 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 28.7
GABPB1-201ENST00000220429 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 EVI5O60447 810 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 INHBCP55103 352 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 NLRP5P59047 1200 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 IQCEQ6IPM2 695 aa14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GABPB1-201ENST00000220429 C5orf60A6NFR6 353 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF233A6NK53 670 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 TRAPPC3O43617 180 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 HSPA1LP34931 641 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 BTDP43251 543 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 GJA8P48165 433 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 NT5C2P49902 561 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF827Q17R98 1081 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 CAVIN3Q969G5 261 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 POLLQ9UGP5 575 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 CFAP73A6NFT4 308 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 BMP15O95972 392 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 DESP17661 470 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 CCNG1P51959 295 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 C2orf54Q08AI8 447 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 ADAM9Q13443 819 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 MORC3Q14149 939 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 CFAP58Q5T655 872 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 SPATA20Q8TB22 786 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 FERMT2Q96AC1 680 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 LTBP1Q14766 1721 aa14.89□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 MFAP3LO75121 409 aa14.88□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 TSPY3P0CV98 308 aa14.88□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 TSPY8P0CW00 308 aa14.88□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 TUBP50607 506 aa14.88□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 PTGDRQ13258 359 aa14.88□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 GRM4Q14833 912 aa14.88□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.88□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.88□□□□□ -0.03
GABPB1-201ENST00000220429 KANK3Q6NY19 840 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms