RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	TMX2	Q9Y320	296 aa		16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	CAP2	P40123	477 aa		16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	CRYM	Q14894	314 aa		16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SH3GL2	Q99962	352 aa		16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		16.94	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	EGFR	P00533	1210 aa		16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	GGCX	P38435	758 aa		16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	ECE1	P42892	770 aa		16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	FNTA	P49354	379 aa		16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	WLS	Q5T9L3	541 aa		16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	ISM2	Q6H9L7	571 aa		16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	ACER1	Q8TDN7	264 aa		16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	GOPC	Q9HD26	462 aa		16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		16.93	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	OR52Z1	P0C646	297 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	MTF1	Q14872	753 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	GRIN2D	O15399	1336 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	PBX1	P40424	430 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SMTN	P53814	917 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	UBE2S	Q16763	222 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	PAGE5	Q96GU1	130 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		16.92	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	GNGT1	P63211	74 aa		16.91	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		16.91	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SPATA20	Q8TB22	786 aa		16.91	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	TEPSIN	Q96N21	525 aa		16.91	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		16.91	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	AMN	Q9BXJ7	453 aa		16.91	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SH2D4A	Q9H788	454 aa		16.91	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SPON1	Q9HCB6	807 aa		16.91	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		16.91	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	ASNS	P08243	561 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	MORC3	Q14149	939 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO11	Q86XK2	927 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1B0GUA9	196 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	AFM	P43652	599 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	APBA1	Q02410	837 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	RBL2	Q08999	1139 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	ALS2CL	Q60I27	953 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	AK8	Q96MA6	479 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	VCPKMT	Q9H867	229 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	HACL1	Q9UJ83	578 aa		16.9	■□□□□ 0.3
BBS1-225	ENST00000630659	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	AGPS	O00116	658 aa		16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	NDUFAB1	O14561	156 aa		16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	EDIL3	O43854	480 aa		16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	UBA7	P41226	1012 aa		16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CDR1	P51861	262 aa		16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	SNAP25	P60880	206 aa		16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		16.89	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	16.88	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	16.88	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		16.88	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659		H7C1D1	291 aa		16.88	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	CDC25A	P30304	524 aa		16.88	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	STAT2	P52630	851 aa		16.88	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ITIH3	Q06033	890 aa		16.88	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		16.88	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		16.88	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	SPATA1	Q5VX52	437 aa		16.88	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	16.88	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		16.88	■□□□□ 0.29
BBS1-225	ENST00000630659	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		16.88	■□□□□ 0.29

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