RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 COL4A1P02462 1669 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 VCANP13611 3396 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.77□□□□□ -1.01
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PDE4DIP-241ENST00000616206 TNFRSF10CO14798 259 aa8.76□□□□□ -1.01
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PDE4DIP-241ENST00000616206 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
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PDE4DIP-241ENST00000616206 CHRNDQ07001 517 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 AP3B2Q13367 1082 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
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PDE4DIP-241ENST00000616206 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.76□□□□□ -1.01
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PDE4DIP-241ENST00000616206 PODNQ7Z5L7 613 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 AHI1Q8N157 1196 aa8.76□□□□□ -1.01
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PDE4DIP-241ENST00000616206 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 BMP1P13497 986 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 NEK4P51957 841 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.75□□□□□ -1.01
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PDE4DIP-241ENST00000616206 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 MXD3Q9BW11 206 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 COA1Q9GZY4 146 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 CHST12Q9NRB3 414 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 DACH1Q9UI36 760 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 PTPRCP08575 1304 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 SNAP23O00161 211 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 AOC2O75106 756 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 RAG1P15918 1043 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 PAX3P23760 479 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 KLRK1P26718 216 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 GSTM4Q03013 218 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 PDE4BQ07343 736 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCSK7Q16549 785 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 CST9Q5W186 159 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 CYP4F22Q6NT55 531 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 DLK2Q6UY11 383 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM35AQ86V20 835 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 SUCLG2Q96I99 432 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADAM19Q9H013 955 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 LTBP1Q14766 1721 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 MED23Q9ULK4 1368 aa8.73□□□□□ -1.01
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PDE4DIP-241ENST00000616206 SH3BP5O60239 455 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 CDC25BP30305 580 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 ECE1P42892 770 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPP2R2AP63151 447 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAP7Q14244 749 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 C4orf46Q504U0 113 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 HOOK2Q96ED9 719 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 GGA3Q9NZ52 723 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-241ENST00000616206 LRRC37AA6NMS7 1700 aa8.73□□□□□ -1.01
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