RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 NEK9Q8TD19 979 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 AK8Q96MA6 479 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ECT2Q9H8V3 914 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 TNNC2P02585 160 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 SPDYE6P0CI01 402 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 FBXW4P57775 412 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA2013Q8IYS2 634 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 DACH2Q96NX9 599 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 BLZF1Q9H2G9 400 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 TRPA1O75762 1119 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 TP53BP2Q13625 1128 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 GPBP1Q86WP2 473 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB18Q99592 522 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CNPY3Q9BT09 278 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 UVRAGQ9P2Y5 699 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 JAK2O60674 1132 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 TNNI1P19237 187 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 TRAPPC10P48553 1259 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ABHD8Q96I13 439 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 VPS39Q96JC1 886 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 SGK1O00141 431 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 BATF3Q9NR55 127 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 SYBUQ9NX95 663 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 WDR47O94967 919 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CPP00450 1065 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 SOX6P35712 828 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 IFNAR2P48551 515 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 AP1S2P56377 157 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CAV1Q03135 178 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 FAM227BQ96M60 508 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ITM2BQ9Y287 266 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 SPARCL1Q14515 664 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 NEK8Q86SG6 692 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGEF10O15013 1369 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 AP3B1O00203 1094 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 TEX28O15482 410 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 MED7O43513 233 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 DAB1O75553 588 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 EYA2O00167 538 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINB4P48594 390 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 RMDN1Q96DB5 314 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 STAT2P52630 851 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 MAPRE2Q15555 327 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ATP5JP18859 108 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ATP2B4P23634 1241 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL31Q9H511 634 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms