RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM87BQ96K49 555 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 EPC2Q52LR7 807 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 FBXO11Q86XK2 927 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 AFG1LQ8WV93 481 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 COPS5Q92905 334 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 NEK1Q96PY6 1258 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 COL4A6Q14031 1691 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC69A6NI79 296 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 GPM6BQ13491 265 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 RASEFQ8IZ41 740 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 TMTC2Q8N394 836 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 YME1L1Q96TA2 773 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 CLDND1Q9NY35 253 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 ABCB11O95342 1321 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 MYL10Q9BUA6 226 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 DDAH1O94760 285 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 REC8O95072 547 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 IRS1P35568 1242 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 KRT32Q14532 448 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 HOMER1Q86YM7 354 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 RGS22Q8NE09 1264 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB5O15062 677 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 LIFRP42702 1097 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 KAT2BQ92831 832 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 MTMR8Q96EF0 704 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 AMNQ9BXJ7 453 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 ARIH2O95376 493 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 KIF5BP33176 963 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 PSEN2P49810 448 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGAP1Q07960 439 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 MFSD10Q14728 455 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM192Q8IY95 271 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 EDAQ92838 391 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 PIGSQ96S52 555 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K14Q99558 947 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 CYTH3O43739 400 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 F2P00734 622 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 HSPA4P34932 840 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 STXBP2Q15833 593 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.141e-6■■■■□ 20.8
SGMS1-208ENST00000608287 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 RPAINQ86UA6 219 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 SEPT8Q92599 483 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 TBC1D5Q92609 795 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 IWS1Q96ST2 819 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.16■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 RB1P06400 928 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 RSPH10BP0C881 870 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 CALM1P0DP23 149 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 CALM2P0DP24 149 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 CALM3P0DP25 149 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 RXRAP19793 462 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 LAMC2Q13753 1193 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 PPTC7Q8NI37 304 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 TOP1MTQ969P6 601 aa22.15■■□□□ 1.14
SGMS1-208ENST00000608287 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.15■■□□□ 1.14
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