RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.02□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.02□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 LY9Q9HBG7 655 aa9.02□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 SPC25Q9HBM1 224 aa9.02□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 PITPNM1O00562 1244 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 NMT2O60551 498 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 ZBED4O75132 1171 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 CDKL5O76039 1030 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 SEC24BO95487 1268 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 IQCF3P0C7M6 154 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 PTGS1P23219 599 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 NEK4P51957 841 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 TIGD5Q53EQ6 642 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZUG5 572 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 CHST3Q7LGC8 479 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 BANK1Q8NDB2 785 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 RAD9AQ99638 391 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 MTMR7Q9Y216 660 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 MYH4Q9Y623 1939 aa9.01□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM232C9JQI7 657 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 CPLX1O14810 134 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 SNHG28P0DPA3 235 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 PDHBP11177 359 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 SMARCA1P28370 1054 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 OAZ1P54368 228 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 ANTXR2P58335 489 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF543Q08ER8 600 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 TCTN1Q2MV58 587 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 MICU3Q86XE3 530 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 BRF1Q92994 677 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 DLL3Q9NYJ7 618 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 ITPR1Q14643 2758 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 VWA5AO00534 786 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 TBX10O75333 385 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 STAT3P40763 770 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 GRM4Q14833 912 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 RTN1Q16799 776 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 APOA5Q6Q788 366 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 RPAINQ86UA6 219 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 KIFC2Q96AC6 838 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 CLDND1Q9NY35 253 aa8.99□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 KLRF2D3W0D1 207 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 STXBP3O00186 592 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 KCNJ6P48051 423 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 EVCP57679 992 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 TROAPQ12815 778 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 CLUL1Q15846 466 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 ST3GAL2Q16842 350 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 TKFCQ3LXA3 575 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 KCTD1Q719H9 257 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 ARMCX2Q7L311 632 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 TLK2Q86UE8 772 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF548-208ENST00000597576 FANCBQ8NB91 859 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.6 ms