RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS16Q9H269 839 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 RIC8AQ9NPQ8 531 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 USP40Q9NVE5 1235 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 LRWD1Q9UFC0 647 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 V9GYY5 206 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 PP2D1A8MPX8 630 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 PES1O00541 588 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 KLRC4O43908 158 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF20AO95235 890 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TUBBP07437 444 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT9P35527 623 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT83P78385 493 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CBX1P83916 185 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 PDIA5Q14554 519 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPN21Q16825 1174 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 DESI1Q6ICB0 168 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP4R3AQ6IN85 833 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TTI2Q6NXR4 508 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 RAD9BQ6WBX8 426 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TXLNBQ8N3L3 684 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 OR8K1Q8NGG5 319 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 DCAF4Q8WV16 495 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 RABGGTAQ92696 567 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC7Q99615 494 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TSG101Q99816 390 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CARD6Q9BX69 1037 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 VAT1LQ9HCJ6 419 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP10Q9P2G4 905 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PQJ5 194 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB5O15062 677 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ADAMTS3O15072 1205 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SPTLC1O15269 473 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MARCH6O60337 910 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SRGNP10124 158 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 AKR1B1P15121 316 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TECP42680 631 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TNNI2P48788 182 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC63Q05C16 580 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMD2Q13200 908 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 FIGNQ5HY92 759 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 LYPD8Q6UX82 237 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 UNC13DQ70J99 1090 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 PODNQ7Z5L7 613 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX2Q8IWB9 1127 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MASTLQ96GX5 879 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MTMR9Q96QG7 549 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR24Q96S15 920 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TSGA10Q9BZW7 698 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 NT5C3AQ9H0P0 336 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 LZTFL1Q9NQ48 299 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CAPN11Q9UMQ6 739 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 WIPF1O43516 503 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC25AP30304 524 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TXKP42681 527 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CHMP4BP1P59074 171 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAF1Q13077 416 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 AP3B2Q13367 1082 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MTF1Q14872 753 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF569Q5MCW4 686 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX35Q5T0J7 233 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF662Q6ZS27 426 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC170Q8IYT3 715 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SNX29Q8TEQ0 813 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 RAD54LQ92698 747 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXJ1Q92949 421 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MRIQ9BWK5 157 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 UBA5Q9GZZ9 404 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 HAUS4Q9H6D7 363 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC23Q9UJX2 597 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms