RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 CDC45O75419 566 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 TCTN1Q2MV58 587 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 ADCK5Q3MIX3 580 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 PPP2R2DQ66LE6 453 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 MICU3Q86XE3 530 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.3■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 H3BRB1 525 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 FUT2Q10981 343 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 MBTPS1Q14703 1052 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 APOA5Q6Q788 366 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 SERINC5Q86VE9 423 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 TCEANC2Q96MN5 208 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 USP26Q9BXU7 913 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 MYO9BQ13459 2157 aa15.29■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 ARHGEF15O94989 841 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 CA3P07451 260 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 ITGB5P18084 799 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 UBE2SQ16763 222 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 NLRX1Q86UT6 975 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 KCNB2Q92953 911 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 GPRASP2Q96D09 838 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 ATP9AO75110 1047 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 KCNA2P16389 499 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 TRIM50Q86XT4 487 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 PCDHA6Q9UN73 950 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.27■□□□□ 0.04
CTIF-210ENST00000591412 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.27■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 TREHO43280 583 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 ZBTB43O43298 467 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 IGFBP4P22692 258 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 THPOP40225 353 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 KCNJ6P48051 423 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 DEFB103AP81534 67 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 TAP1Q03518 808 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 KRT32Q14532 448 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 RTN1Q16799 776 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 CDHR1Q96JP9 859 aa15.26■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 EPOPA6NHQ4 379 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 KIF28PB7ZC32 967 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 LGR5O75473 907 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 RSPH10BP0C881 870 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 ADAM17P78536 824 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 PPM1EQ8WY54 764 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 JADE2Q9NQC1 790 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 SETD4Q9NVD3 440 aa15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 V9GY48 417 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 EMSYQ7Z589 1322 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 PTPRSQ13332 1948 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 RFXAPO00287 272 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 TLL1O43897 1013 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 EFCAB14O75071 495 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 CAND2O75155 1236 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 CDC27P30260 824 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 RCAN1P53805 252 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 SP4Q02446 784 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 MTMR1Q13613 665 aa15.24■□□□□ 0.03
CTIF-210ENST00000591412 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms