RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589232.5

GTF3C2-AS1-206, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 254 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GPATCH11Q8N954 259 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RAD9AQ99638 391 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGFLR1Q9H665 355 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HOMER2Q9NSB8 354 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CDH22Q9UJ99 828 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZFHX4Q86UP3 3567 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CEP250Q9BV73 2442 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 USP24Q9UPU5 2620 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 H3BNC9 293 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SRGAP3O43295 1099 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IDH1O75874 414 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CABYRO75952 493 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BAIAP3O94812 1187 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GLP2RO95838 553 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 S1PR4O95977 384 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KCNJ6P48051 423 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CHMP4BP1P59074 171 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C8orf34Q49A92 452 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MUM1L1Q5H9M0 696 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TTC39AQ5SRH9 613 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM179Q6ZVK1 233 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SMC5Q8IY18 1101 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 STK11IPQ8N1F8 1099 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ANKRD35Q8N283 1001 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LCORLQ8N3X6 602 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DCLK2Q8N568 766 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DDRGK1Q96HY6 314 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MSLNLQ96KJ4 702 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TEX13BQ9BXU2 312 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 AP5M1Q9H0R1 490 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 INCENPQ9NQS7 918 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MCM9Q9NXL9 1143 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CLEC1BQ9P126 229 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EVPLQ92817 2033 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WDR81Q562E7 1941 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PTPRCP08575 1304 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SMAPO00193 183 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 UPP2O95045 317 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NDUFB10O96000 172 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CXCL10P02778 98 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SP100P23497 879 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DNAJB1P25685 340 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RFC2P35250 354 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CDK8P49336 464 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SIGLEC14Q08ET2 396 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ADAM15Q13444 863 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TNNI3KQ59H18 835 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CNKSR3Q6P9H4 555 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SKAP1Q86WV1 359 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM192Q8IY95 271 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIAA2013Q8IYS2 634 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RETREG2Q8NC44 543 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FEZF2Q8TBJ5 459 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SLF1Q9BQI6 1058 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SLC24A3Q9HC58 644 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MYH15Q9Y2K3 1946 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DOCK8Q8NF50 2099 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CHD6Q8TD26 2715 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 F5H6K3 240 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ACACBO00763 2458 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ATP2A1O14983 1001 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PI15O43692 258 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ARIH2O95376 493 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CKBP12277 381 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SELPP16109 830 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KLRC3Q07444 240 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PTGISQ16647 500 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TIGD5Q53EQ6 642 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms