RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 MYL1P05976 194 aa34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PLCG1P19174 1290 aa34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 C17orf99Q6UX52 265 aa34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 B3GNT9Q6UX72 402 aa34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 DOCK5Q9H7D0 1870 aa34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 MUTP22033 750 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ICAM3P32942 547 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE4DQ08499 809 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 NCAPH2Q6IBW4 605 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPY26PQ9H489 355 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 RPA1P27694 616 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 GRB10Q13322 594 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM119Q4V9L6 283 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 NAALADL2Q58DX5 795 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR142Q7Z601 462 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHH3Q7Z736 793 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 MORC4Q8TE76 937 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PAGE5Q96GU1 130 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 CPA4Q9UI42 421 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBE1Q9UJT0 475 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ASB14A6NK59 587 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX15O43143 795 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 CA12O43570 354 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 NFASCO94856 1347 aa34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PGK2P07205 417 aa34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 GRB14Q14449 540 aa34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 NEK9Q8TD19 979 aa34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 CAPNS2Q96L46 248 aa34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 FGD4Q96M96 766 aa34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PNMA5Q96PV4 448 aa34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS20O76081 388 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ADORA2AP29274 412 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF792Q3KQV3 632 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 NT5DC1Q5TFE4 455 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 UIMC1Q96RL1 719 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 TUFT1Q9NNX1 390 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 KBTBD4Q9NVX7 518 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC15A5A6NIM6 579 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SMC2O95347 1197 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 CAVIN2O95810 425 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 AMPD3Q01432 767 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT76Q01546 638 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 TYRO3Q06418 890 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PNOCQ13519 176 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 EPHA7Q15375 998 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT12Q9BQG2 462 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC5A4Q9NY91 659 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNV1Q6PIU1 500 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 RDM1Q8NG50 284 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA20Q8TB22 786 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SENP7Q9BQF6 1050 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC27Q9C0I9 530 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 UNC45AQ9H3U1 944 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 TGFB3P10600 412 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SFNP31947 248 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA3FQ13275 785 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 GRM1Q13255 1194 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 CRHR2Q13324 411 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 STX1AQ16623 288 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 GAS2L3Q86XJ1 694 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SMARCE1Q969G3 411 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ANO10Q9NW15 660 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 EML1O00423 815 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXN1O15353 648 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNA2P16389 499 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 AFMP43652 599 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SARSP49591 514 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 JAK3P52333 1124 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 CATSPER3Q86XQ3 398 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIML1Q8N9V2 468 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ZIC5Q96T25 663 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PLIN2Q99541 437 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD17B14Q9BPX1 270 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-206ENST00000588815 FSD2A1L4K1 749 aa34.76■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP9AO75110 1047 aa34.76■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 MED24O75448 989 aa34.76■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 DPYDQ12882 1025 aa34.76■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 SV2BQ7L1I2 683 aa34.76■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 MIER3Q7Z3K6 550 aa34.76■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 RAD54LQ92698 747 aa34.76■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 GSDMAQ96QA5 445 aa34.76■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa34.76■■■■□ 3.15
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa34.75■■■■□ 3.15
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