RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 MCM8Q9UJA3 840 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 PIK3C2GO75747 1445 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 KIF1BO60333 1816 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 ATP7BP35670 1465 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB7AO95365 584 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 ECI1P42126 302 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 RTP2Q5QGT7 225 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 FERMT3Q86UX7 667 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 UBR7Q8N806 425 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 SSH2Q76I76 1423 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 CLTCL1P53675 1640 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 ARNTLO00327 626 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 EXOC5O00471 708 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 CD3EP07766 207 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 PDGFRBP09619 1106 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 IFNGR1P15260 489 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 CPEP16870 476 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 HSPA6P17066 643 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 SDSP20132 328 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 SCRN1Q12765 414 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 TXNRD1Q16881 649 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 BRAPQ7Z569 592 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 JAMLQ86YT9 394 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 AHI1Q8N157 1196 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 ATL2Q8NHH9 583 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 PTPRN2Q92932 1015 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRM-208ENST00000578600 BLACEA4D250 179 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 STXBP3O00186 592 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 OPA1O60313 960 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 ESR1P03372 595 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 THBDP07204 575 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 SYPP08247 313 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 FLT3P36888 993 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 NEK4P51957 841 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TESK1Q15569 626 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 CHRNA2Q15822 529 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 USP53Q70EK8 1073 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 RNF180Q86T96 592 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 FRS2Q8WU20 508 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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PTPRM-208ENST00000578600 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 TCFL5Q9UL49 500 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 DLC1Q96QB1 1528 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 CRB1P82279 1406 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 GCP02774 474 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 ASLP04424 464 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 DUSP13Q9UII6 198 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 RNF112Q9ULX5 631 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-208ENST00000578600 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.2□□□□□ -1.26
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