RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP4R3AQ6IN85 833 aa37.59■■■■□ 3.61
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BCAS3Q9H6U6 928 aa37.58■■■■□ 3.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF28PB7ZC32 967 aa37.57■■■■□ 3.61
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D22BQ9NU19 505 aa37.52■■■■□ 3.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC9A2Q9UBY0 812 aa37.52■■■■□ 3.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TELO2Q9Y4R8 837 aa37.46■■■■□ 3.59
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 KAT2BQ92831 832 aa37.42■■■■□ 3.58
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