RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	KCNB1	Q14721	858 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	USH1G	Q495M9	461 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	AMN	Q9BXJ7	453 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	PLXNB2	O15031	1838 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	BRCA2	P51587	3418 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	MEIS2	O14770	477 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	HAS1	Q92839	578 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	PNMA5	Q96PV4	448 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	MYPN	Q86TC9	1320 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279		A0A1B0GTH6	734 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	FKTN	O75072	461 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	COBL	O75128	1261 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	ERCC3	P19447	782 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	PRCP	P42785	496 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	PSMC4	P43686	418 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	PAK1	Q13153	545 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	GRB10	Q13322	594 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	PDIA5	Q14554	519 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	NR1I3	Q14994	352 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	FBXO11	Q86XK2	927 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	NELFB	Q8WX92	580 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	ANO3	Q9BYT9	981 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	POTEM	A6NI47	508 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	USP27X	A6NNY8	438 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	PLA2G6	O60733	806 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	ZBED4	O75132	1171 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	RHOBTB3	O94955	611 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	ALAS1	P13196	640 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	STAT3	P40763	770 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	SEMA3F	Q13275	785 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	AP3B2	Q13367	1082 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	ADSSL1	Q8N142	457 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	CALML4	Q96GE6	196 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM9	Q9C026	710 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	KCND1	Q9NSA2	647 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	OPLAH	O14841	1288 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	USP11	P51784	963 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	MBOAT7	Q96N66	472 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	RAB34	Q9BZG1	259 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	GABRQ	Q9UN88	632 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TCF4-231	ENST00000566279	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	TPM2	P07951	284 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	CYP3A7	P24462	503 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	GPR142	Q7Z601	462 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	MB21D1	Q8N884	522 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	GJA10	Q969M2	543 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	TMX1	Q9H3N1	280 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	STK17A	Q9UEE5	414 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	NFIB	O00712	420 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ICAM1	P05362	532 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ASIC1	P78348	528 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	KRT79	Q5XKE5	535 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6

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