RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 C16orf59Q7L2K0 433 aa35.15■■■■□ 3.22
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CMTM4-204ENST00000563952 JADE2Q9NQC1 790 aa35.15■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 ESYT2A0FGR8 921 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 ATP9AO75110 1047 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 SEC24BO95487 1268 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 TRIM22Q8IYM9 498 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 SCLYQ96I15 445 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 C16orf70Q9BSU1 422 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 ZMYND12Q9H0C1 365 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 IL23AQ9NPF7 189 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 TELO2Q9Y4R8 837 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 LGALS2P05162 132 aa35.13■■■■□ 3.21
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CMTM4-204ENST00000563952 MXRA8Q9BRK3 442 aa35.13■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa35.13■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 ADAMTS3O15072 1205 aa35.12■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF365Q70YC5 407 aa35.12■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 VPS54Q9P1Q0 977 aa35.12■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 SREBF1P36956 1147 aa35.11■■■■□ 3.21
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CMTM4-204ENST00000563952 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
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CMTM4-204ENST00000563952 CYP2W1Q8TAV3 490 aa35.11■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 H3BRB1 525 aa35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 GNA11P29992 359 aa35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF76P36508 570 aa35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 BFSP2Q13515 415 aa35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 GPR153Q6NV75 609 aa35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 CTAGE1Q96RT6 745 aa35.1■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
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CMTM4-204ENST00000563952 TRIM50Q86XT4 487 aa35.09■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
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CMTM4-204ENST00000563952 TPCN1Q9ULQ1 816 aa35.09■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 SZT2Q5T011 3432 aa35.09■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 AK2P54819 239 aa35.08■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 CEP55Q53EZ4 464 aa35.08■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 Q7L0L9 218 aa35.08■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC155Q8N6L0 562 aa35.08■■■■□ 3.21
CMTM4-204ENST00000563952 PITPNM1O00562 1244 aa35.07■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 MCTP2Q6DN12 878 aa35.07■■■■□ 3.2
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CMTM4-204ENST00000563952 BICD2Q8TD16 824 aa35.07■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 RASGRP4Q8TDF6 673 aa35.07■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 DEXIO95424 95 aa35.06■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 FGBP02675 491 aa35.06■■■■□ 3.2
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CMTM4-204ENST00000563952 SH3GLB2Q9NR46 395 aa35.06■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
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CMTM4-204ENST00000563952 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa35.05■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa35.05■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 NLRP5P59047 1200 aa35.05■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 CAGE1Q8TC20 777 aa35.05■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
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CMTM4-204ENST00000563952 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
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CMTM4-204ENST00000563952 HIC1Q14526 733 aa35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 OTOP2Q7RTS6 562 aa35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 SEPT1Q8WYJ6 367 aa35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 SDF4Q9BRK5 362 aa35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa35.03■■■■□ 3.2
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CMTM4-204ENST00000563952 HERVK_113Q902F9 699 aa35.03■■■■□ 3.2
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CMTM4-204ENST00000563952 AFAP1L1Q8TED9 768 aa35.02■■■■□ 3.2
CMTM4-204ENST00000563952 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
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CMTM4-204ENST00000563952 RFC2P35250 354 aa35.01■■■■□ 3.2
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CMTM4-204ENST00000563952 PLA2G4DQ86XP0 818 aa35.01■■■■□ 3.2
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