RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 GJB5O95377 273 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 AMHP03971 560 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 LGALS2P05162 132 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 ICAM3P32942 547 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 GNAQP50148 359 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 DEFB103AP81534 67 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 TFF2Q03403 129 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 GRB10Q13322 594 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 METTL7BQ6UX53 244 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 HLA-CQ95604 372 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 MTA3Q9BTC8 594 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 INSL6Q9Y581 213 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.41□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 LCHNA4D1U4 455 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 CCDC69A6NI79 296 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 FIBPO43427 364 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 PRC1O43663 620 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 DDAH1O94760 285 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 CALM1P0DP23 149 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 CALM2P0DP24 149 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 CALM3P0DP25 149 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 MCM5P33992 734 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 KCNQ1P51787 676 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 ANTXR2P58335 489 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 HIC1Q14526 733 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 MBTPS1Q14703 1052 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 KRT40Q6A162 431 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 NLRX1Q86UT6 975 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 WNT8BQ93098 351 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 GPR20Q99678 358 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 LY9Q9HBG7 655 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.4□□□□□ -0.9
COCH-211ENST00000557065 PIK3CDO00329 1044 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 MEIS2O14770 477 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 TREHO43280 583 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 LPXNO60711 386 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 CAND2O75155 1236 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 ERVK-21P61565 698 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 TCTN1Q2MV58 587 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 SEPT8Q92599 483 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 CDHR1Q96JP9 859 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 TMEM87BQ96K49 555 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 MYL10Q9BUA6 226 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 SETD4Q9NVD3 440 aa9.39□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 LINC01553A4QN01 128 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 MAFGO15525 162 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 COL9A1P20849 921 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 HOXC8P31273 242 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 ARHGAP4P98171 946 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 SP4Q02446 784 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 SEMA3FQ13275 785 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 SPRED2Q7Z698 418 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 FANCBQ8NB91 859 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 GPRASP2Q96D09 838 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.38□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.37□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 NRCAMQ92823 1304 aa9.37□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 UPP2O95045 317 aa9.37□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 CTSHP09668 335 aa9.37□□□□□ -0.91
COCH-211ENST00000557065 LIFRP42702 1097 aa9.37□□□□□ -0.91
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