RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549940.5

GNPTAB-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 1,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-206ENST00000549940 CHMP2AO43633 222 aa31.08■■■□□ 2.57
GNPTAB-206ENST00000549940 SMC2O95347 1197 aa31.08■■■□□ 2.57
GNPTAB-206ENST00000549940 NAALADL2Q58DX5 795 aa31.08■■■□□ 2.57
GNPTAB-206ENST00000549940 CREBZFQ9NS37 354 aa31.08■■■□□ 2.57
GNPTAB-206ENST00000549940 ASTN1O14525 1302 aa31.08■■■□□ 2.57
GNPTAB-206ENST00000549940 NOGQ13253 232 aa31.07■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 DEFB115Q30KQ5 88 aa31.07■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 SMARCE1Q969G3 411 aa31.07■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 PNMA5Q96PV4 448 aa31.07■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 EDNRBP24530 442 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 STX1AQ16623 288 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 HYIQ5T013 277 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 TUBE1Q9UJT0 475 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 TLR2O60603 784 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 RPA1P27694 616 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 APLP1P51693 650 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 TMEM119Q4V9L6 283 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 GPR142Q7Z601 462 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 ADGRA2Q96PE1 1338 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 UNC45AQ9H3U1 944 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 ANO10Q9NW15 660 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 PRR29P0C7W0 189 aa31.05■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 ADORA2AP29274 412 aa31.05■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 AMPD3Q01432 767 aa31.05■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 PLEKHH3Q7Z736 793 aa31.05■■■□□ 2.56
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GNPTAB-206ENST00000549940 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 KIAA1024Q9UPX6 916 aa31.05■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 FSD2A1L4K1 749 aa31.04■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 EML1O00423 815 aa31.04■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 SV2BQ7L1I2 683 aa31.04■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 KBTBD4Q9NVX7 518 aa31.04■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 POTEB3A0JP26 581 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 RASSF10A6NK89 507 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 DHX15O43143 795 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
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GNPTAB-206ENST00000549940 MYL1P05976 194 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 POTEBQ6S5H4 581 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 CATSPER3Q86XQ3 398 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 ZIC5Q96T25 663 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 ASB14A6NK59 587 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 BIN1O00499 593 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 ATP9AO75110 1047 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 MED24O75448 989 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 ALDH1A1P00352 501 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 EPHA7Q15375 998 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 ECM1Q16610 540 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 B3GNT9Q6UX72 402 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 MIER3Q7Z3K6 550 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 RAD54LQ92698 747 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
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GNPTAB-206ENST00000549940 C17orf99Q6UX52 265 aa31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 SEPT14Q6ZU15 432 aa31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 CAPNS2Q96L46 248 aa31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 TUFT1Q9NNX1 390 aa31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-206ENST00000549940 CAVIN2O95810 425 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 ICAM3P32942 547 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 KRT76Q01546 638 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 SEMA3FQ13275 785 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 ANO6Q4KMQ2 910 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 NT5DC1Q5TFE4 455 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 DPP9Q86TI2 863 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 KCTD17Q8N5Z5 321 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 LRRC15Q8TF66 581 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 FGD4Q96M96 766 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 MTRQ99707 1265 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 LRRC27Q9C0I9 530 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 SAMM50Q9Y512 469 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 NLRP12P59046 1061 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 CYP4A11Q02928 519 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 CRHR2Q13324 411 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 GRB14Q14449 540 aa31■■■□□ 2.55
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GNPTAB-206ENST00000549940 DNM3Q9UQ16 869 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 PLXNB2O15031 1838 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 CA12O43570 354 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 KCNA2P16389 499 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 SARSP49591 514 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 CUL4BQ13620 913 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 SPATA20Q8TB22 786 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-206ENST00000549940 RGL1Q9NZL6 768 aa31■■■□□ 2.55
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