RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 ATP2B1P20020 1258 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 KIR3DS1Q14943 382 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 MCM10Q7L590 875 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 CRB1P82279 1406 aa6.84□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ADAMTS20P59510 1910 aa6.84□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 RFXAPO00287 272 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 GCP02774 474 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 IMPDH2P12268 514 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 VIPR1P32241 457 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 RELTQ969Z4 430 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 NBPF4Q96M43 638 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 USP35Q9P2H5 1018 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 PEAK1Q9H792 1746 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.83□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 TMEM94Q12767 1356 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 SIGLEC6O43699 453 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 PNLIPP16233 465 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 KRT24Q2M2I5 525 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 IL17REQ8NFR9 667 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ATG4CQ96DT6 458 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 SHDQ96IW2 340 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 DRC1Q96MC2 740 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 IRAK3Q9Y616 596 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 USP19O94966 1318 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ETFBP38117 255 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 GIPRP48546 466 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 RTP1P59025 263 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.81□□□□□ -1.32
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TRDN-205ENST00000546248 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 DDX19BQ9UMR2 479 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 NWD1Q149M9 1564 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 RTL1A6NKG5 1358 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 KIAA0232Q92628 1395 aa6.81□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 KIF16BQ96L93 1317 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 N4BP3O15049 544 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 CLEC3AO75596 197 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ATF3P18847 181 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 CDR1P51861 262 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ERVFRD-1P60508 538 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 MST1RQ04912 1400 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 TMEM192Q8IY95 271 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 CHST7Q9NS84 486 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 PIK3C2AO00443 1686 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 MSH6P52701 1360 aa6.8□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 ITSN1Q15811 1721 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 MEIS1O00470 390 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 CTSKP43235 329 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 RGS3P49796 1198 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDN-205ENST00000546248 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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