RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	NEMP1	O14524	444 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	AURKA	O14965	403 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	CD3E	P07766	207 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	IFNGR1	P15260	489 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	ARL4A	P40617	200 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	EPHB1	P54762	984 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	POU4F1	Q01851	419 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	GUCY1A3	Q02108	690 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	LAPTM5	Q13571	262 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	KIR3DS1	Q14943	382 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC41	Q15345	812 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM129C	Q86XR2	697 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC103	Q8IW40	242 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	COG1	Q8WTW3	980 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	AQP7	O14520	342 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	TSPAN6	O43657	245 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	MSC	O60682	206 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	GSN	P06396	782 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	FLT3	P36888	993 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	VMAC	Q2NL98	169 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	TMC6	Q7Z403	805 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	LDHD	Q86WU2	507 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	SP8	Q8IXZ3	490 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	WNK4	Q96J92	1243 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	SHTN1	A0MZ66	631 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308		B4E1Z4	1266 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308		M0R2C6	588 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	ARVCF	O00192	962 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	CBX4	O00257	560 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	BRINP1	O60477	761 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	LCP1	P13796	627 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKCA	P17252	672 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	TBX4	P57082	545 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR85	P60893	370 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	TMPRSS15	P98073	1019 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	ITK	Q08881	620 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	TESK1	Q15569	626 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	NXPE1	Q8N323	547 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	USP7	Q93009	1102 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	MTMR8	Q96EF0	704 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	C8orf48	Q96LL4	319 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC1	Q99614	292 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	IFT22	Q9H7X7	185 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PQY0	241 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF205	O95201	554 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	CKM	P06732	381 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	PLS3	P13797	630 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	BMP8B	P34820	402 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB27A	P51159	221 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SNHG1-222	ENST00000545308	NEK2	P51955	445 aa		5.48	□□□□□ -1.53

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