RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 C1QTNF8P60827 252 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 SCFD2Q8WU76 684 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 GLG1Q92896 1179 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 PORCNQ9H237 461 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 JADE2Q9NQC1 790 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 DNM3Q9UQ16 869 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 MYH8P13535 1937 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 A0A1B0GVL5 298 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 ZEB2O60315 1214 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 PSAPP07602 524 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 PGM5Q15124 567 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TPH2Q8IWU9 490 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 GLMNQ92990 594 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 PTPN18Q99952 460 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 CSRNP2Q9H175 543 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 SFNP31947 248 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 SPECC1Q5M775 1068 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 SV2BQ7L1I2 683 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 PLPP6Q8IY26 295 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 REPS2Q8NFH8 660 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 CLIC6Q96NY7 704 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 PLIN2Q99541 437 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 RIT2Q99578 217 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 SORBS3O60504 671 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 PEX10O60683 326 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 STIM1Q13586 685 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 Q4G0T1 1027 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 VTA1Q9NP79 307 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 RNF186Q9NXI6 227 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 DACT1Q9NYF0 836 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 WDR64B1ANS9 1081 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 IDEP14735 1019 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 CIITAP33076 1130 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 HTRA3P83110 453 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 PDIA5Q14554 519 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 ARMCX2Q7L311 632 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 NEK9Q8TD19 979 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 APBA2Q99767 749 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 DACH1Q9UI36 760 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 GPR25O00155 361 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 GH1P01241 217 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TGFB3P10600 412 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 PRMT2P55345 433 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 CAMK4Q16566 473 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 C17orf99Q6UX52 265 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 SMARCE1Q969G3 411 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 C2orf72A6NCS6 295 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 MEIS1O00470 390 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 GGPS1O95749 300 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 GNRH1P01148 92 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 PFKFB1P16118 471 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 AFMP43652 599 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 FOXK1P85037 733 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 EPHA7Q15375 998 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TNFRSF25Q93038 417 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TRIM47Q96LD4 638 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 NACC1Q96RE7 527 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 TINF2Q9BSI4 451 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRO-210ENST00000544244 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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