RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NMT2O60551 498 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RXRAP19793 462 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ICA1Q05084 483 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDX11Q96FC9 970 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GBP4Q96PP9 640 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PICK1Q9NRD5 415 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM51Q9NW97 253 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NYAP2Q9P242 653 aa6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STX6O43752 255 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DEXIO95424 95 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EGFRP00533 1210 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GH2P01242 217 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM157BP0CG42 384 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFNAR1P17181 557 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FGFR3P22607 806 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAP2P40123 477 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEPT2Q15019 361 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCAF4Q8WV16 495 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYL10Q9BUA6 226 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NID2Q14112 1375 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRMT3O60678 531 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GRM4Q14833 912 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OCLNQ16625 522 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LCE1DQ5T752 114 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLFN13Q68D06 897 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCTP1Q6DN14 999 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MKL1Q969V6 931 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C8orf76Q96K31 380 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FEZ1Q99689 392 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RRAGCQ9HB90 399 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CSADQ9Y600 493 aa6.45□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STK36Q9NRP7 1315 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLRF2D3W0D1 207 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 JAK2O60674 1132 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SYT1P21579 422 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITGB7P26010 798 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMARCA1P28370 1054 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDC27P30260 824 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC1A4P43007 532 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP2K3P46734 347 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP14P54578 494 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TROAPQ12815 778 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAF1Q13077 416 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIF1AQ16665 826 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPH6Q7L8W6 267 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBXN4Q92575 508 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHKBQ93100 1093 aa6.44□□□□□ -1.38
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLRG1Q96E93 195 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms