RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	BMPR1A	P36894	532 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	PGM5	Q15124	567 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	IER5L	Q5T953	404 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	SEPT8	Q92599	483 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	ESR2	Q92731	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	ENPP3	O14638	875 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	KDM4A	O75164	1064 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	LGALS2	P05162	132 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	RB1	P06400	928 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	ADAM15	Q13444	863 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	RPAIN	Q86UA6	219 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	RNF135	Q8IUD6	432 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	IL17RA	Q96F46	866 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	YME1L1	Q96TA2	773 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	SETD4	Q9NVD3	440 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	CLDND1	Q9NY35	253 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198		B4E1Z4	1266 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF213	O14771	459 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC01565	O15544	149 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	NCK2	O43639	380 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	CAND2	O75155	1236 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	SDS	P20132	328 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	ICAM3	P32942	547 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	SEC23A	Q15436	765 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	PRSS33	Q8NF86	280 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	EDA	Q92838	391 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	GPR20	Q99678	358 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	AMN	Q9BXJ7	453 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	KAT14	Q9H8E8	782 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	ZBTB5	O15062	677 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	TBX10	O75333	385 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	EYA4	O95677	639 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	CTSH	P09668	335 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	DNAJB1	P25685	340 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	NT5C2	P49902	561 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	MGAT3	Q09327	533 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	FIBCD1	Q8N539	461 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	USP26	Q9BXU7	913 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	CLEC1B	Q9P126	229 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	MYO7A	Q13402	2215 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	KLRF2	D3W0D1	207 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	CYTH3	O43739	400 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	DGKI	O75912	1065 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	TCF15	Q12870	199 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	LPIN1	Q14693	890 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	CLUL1	Q15846	466 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	METTL7B	Q6UX53	244 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	IQCA1	Q86XH1	822 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM50	Q86XT4	487 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	APBB2	Q92870	758 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	SNX27	Q96L92	541 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM50B	Q9Y247	325 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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