RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 MAN2A1Q16706 1144 aa8.39□□□□□ -1.07
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PACS1-211ENST00000531298 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.39□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.39□□□□□ -1.07
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PACS1-211ENST00000531298 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.39□□□□□ -1.07
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PACS1-211ENST00000531298 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 KCNN1Q92952 543 aa8.38□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ERO1AQ96HE7 468 aa8.38□□□□□ -1.07
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PACS1-211ENST00000531298 SLF1Q9BQI6 1058 aa8.38□□□□□ -1.07
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PACS1-211ENST00000531298 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa8.38□□□□□ -1.07
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PACS1-211ENST00000531298 PDXKO00764 312 aa8.37□□□□□ -1.07
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PACS1-211ENST00000531298 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.37□□□□□ -1.07
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PACS1-211ENST00000531298 ABCD1P33897 745 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 ECE1P42892 770 aa8.37□□□□□ -1.07
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PACS1-211ENST00000531298 RBL2Q08999 1139 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 COASYQ13057 564 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 PRR16Q569H4 304 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.37□□□□□ -1.07
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PACS1-211ENST00000531298 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.37□□□□□ -1.07
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PACS1-211ENST00000531298 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 NACC1Q96RE7 527 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PACS1-211ENST00000531298 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.37□□□□□ -1.07
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