RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521364.5

CSNK1G3-210, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CSNK1G3, Length 2,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF862O60290 1169 aa6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 PLOD3O60568 738 aa6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 ITGA6P23229 1130 aa6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 RXRBP28702 533 aa6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 GBP1P32455 592 aa6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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CSNK1G3-210ENST00000521364 PPP2R5DQ14738 602 aa6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 WDR44Q5JSH3 913 aa6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 DPP9Q86TI2 863 aa6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 DENND1CQ8IV53 801 aa6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 KRT78Q8N1N4 520 aa6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.5□□□□□ -1.37
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CSNK1G3-210ENST00000521364 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.5□□□□□ -1.37
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CSNK1G3-210ENST00000521364 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 BLMHQ13867 455 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 MVB12AQ96EY5 273 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 H3BML4 177 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 TBX18O95935 607 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM200BP0CF97 657 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 IKBKEQ14164 716 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRR16Q569H4 304 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 DCAF4Q8WV16 495 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 GP6Q9HCN6 339 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.49□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 GHRHP01286 108 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 CTSBP07858 339 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 CKMT1AP12532 417 aa6.48□□□□□ -1.37
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CSNK1G3-210ENST00000521364 PDCP20941 246 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 CDC25BP30305 580 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 PFKPQ01813 784 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 POSTNQ15063 836 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 HSCBQ8IWL3 235 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 GOLGA1Q92805 767 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 MSCO60682 206 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 VAMP4O75379 141 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 SCP2P22307 547 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 HOXC12P31275 282 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 HOXC13P31276 330 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPLD1P80108 840 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 GSTM4Q03013 218 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARL8AQ96BM9 186 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 USP26Q9BXU7 913 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 BRD9Q9H8M2 597 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 CEP72Q9P209 647 aa6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CSNK1G3-210ENST00000521364 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.48□□□□□ -1.37
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