RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 DYNLL2Q96FJ2 89 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-211ENST00000520276 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC12A7Q9Y666 1083 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-211ENST00000520276 HSF2BPO75031 334 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-211ENST00000520276 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-211ENST00000520276 HPDP32754 393 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-211ENST00000520276 ZHX2Q9Y6X8 837 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-211ENST00000520276 VPS16Q9H269 839 aa11.11□□□□□ -0.63
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TRPS1-211ENST00000520276 GOPCQ9HD26 462 aa11.11□□□□□ -0.63
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TRPS1-211ENST00000520276 TRAF5O00463 557 aa11.11□□□□□ -0.63
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TRPS1-211ENST00000520276 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.1□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 ALS2CLQ60I27 953 aa11.1□□□□□ -0.63
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TRPS1-211ENST00000520276 ADGRA1Q86SQ6 560 aa11.1□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.1□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa11.1□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 SPAG5Q96R06 1193 aa11.1□□□□□ -0.63
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