RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 RASSF7Q02833 373 aa25.4■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.4■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 RETREG2Q8NC44 543 aa25.4■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.4■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 DNAJC7Q99615 494 aa25.4■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 NUP58Q9BVL2 599 aa25.4■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.4■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.39■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF536O15090 1300 aa25.39■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 FANCGO15287 622 aa25.39■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.39■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.39■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 ANKRD7Q92527 254 aa25.39■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 SLC5A5Q92911 643 aa25.39■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.39■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 PRELPP51888 382 aa25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 PSMC6P62333 389 aa25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 HACL1Q9UJ83 578 aa25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 EML1O00423 815 aa25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 PSMD10O75832 226 aa25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 SLU7O95391 586 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 HSD17B4P51659 736 aa25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 MAP7D2Q96T17 732 aa25.38■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 MEIS1O00470 390 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 PPP2R5CQ13362 524 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 MAN2A1Q16706 1144 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 VWA3BQ502W6 1294 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 CEP55Q53EZ4 464 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 ERO1AQ96HE7 468 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 RASSF10A6NK89 507 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 KIF20AO95235 890 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 FIGNQ5HY92 759 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 IQCDQ96DY2 449 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.37■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 GNG11P61952 73 aa25.36■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 GIT2Q14161 759 aa25.36■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.36■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 UBXN2AP68543 259 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 GHRHRQ02643 423 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 CYP4A11Q02928 519 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 NDST4Q9H3R1 872 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 DOCK1Q14185 1865 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 EYA4O95677 639 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 HOOK2Q96ED9 719 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 WDR24Q96S15 920 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.35■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 RPTORQ8N122 1335 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 A0A1W2PQJ5 194 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 SOCS7O14512 581 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 KLK7P49862 253 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 CEP63Q96MT8 703 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 REEP2Q9BRK0 252 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 MEA1Q16626 185 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 RGL1Q9NZL6 768 aa25.34■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 CASQ1P31415 396 aa25.33■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 ZBED6P86452 979 aa25.33■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 ACRBPQ8NEB7 543 aa25.33■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 CHP1Q99653 195 aa25.33■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.33■■□□□ 1.65
PDE4D-223ENST00000515011 GAS7O60861 476 aa25.32■■□□□ 1.64
PDE4D-223ENST00000515011 DCAF15Q66K64 600 aa25.32■■□□□ 1.64
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