RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 SDF4Q9BRK5 362 aa20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 GRIN2DO15399 1336 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 SP4Q02446 784 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 FAAP100Q0VG06 881 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 TBCKQ8TEA7 893 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 FAM86B1E9PN63 330 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 M0R2N6 131 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF286BP0CG31 522 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 ARP10275 920 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 CIITAP33076 1130 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 KRT2P35908 639 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 NPY5RQ15761 445 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 GPR20Q99678 358 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 NFASCO94856 1347 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 F2P00734 622 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 PSEN2P49810 448 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 FOSBP53539 338 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 MFSD10Q14728 455 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 PRR16Q569H4 304 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 KAT2BQ92831 832 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 H3BRB1 525 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 KIAA0355O15063 1070 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 LGALS2P05162 132 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 RAG1P15918 1043 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 KRT40Q6A162 431 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 C7orf31Q8N865 590 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 TMX3Q96JJ7 454 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 C8orf76Q96K31 380 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 KIF3AQ9Y496 699 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-215ENST00000514625 CEP290O15078 2479 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 B4GALT4O60513 344 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 CD4P01730 458 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 MMP1P03956 469 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 INF2Q27J81 1249 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 OXER1Q8TDS5 423 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 NOD1Q9Y239 953 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 HAS3O00219 553 aa20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 SESTD1Q86VW0 696 aa20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 TBX21Q9UL17 535 aa20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 NEK8Q86SG6 692 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 GLG1Q92896 1179 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 GDF15Q99988 308 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.29■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 TIMP1P01033 207 aa20.29■□□□□ 0.84
FAAP20-215ENST00000514625 CYP3A7P24462 503 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms