RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514596.1

CTBP1-215, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTBP1, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-215ENST00000514596 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 TFF2Q03403 129 aa21.42■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 AP3B2Q13367 1082 aa21.42■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 UBE2SQ16763 222 aa21.42■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.42■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 C6orf50Q9HD87 102 aa21.42■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.42■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 CABYRO75952 493 aa21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 GNA11P29992 359 aa21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 MCTP2Q6DN12 878 aa21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 NECAB1Q8N987 351 aa21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 IL31RAQ8NI17 732 aa21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 BICD2Q8TD16 824 aa21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 Q9Y3F1 56 aa21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 TRANK1O15050 2925 aa21.41■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 KCNQ1P51787 676 aa21.4■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 RABGGTBP53611 331 aa21.4■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 NKX3-2P78367 333 aa21.4■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 TTLL4Q14679 1199 aa21.4■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.4■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.4■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 TLK2Q86UE8 772 aa21.4■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 WASF1Q92558 559 aa21.4■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.4■■□□□ 1.02
CTBP1-215ENST00000514596 CTDNEP1O95476 244 aa21.39■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 SMPD1P17405 629 aa21.39■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 XBP1P17861 261 aa21.39■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.39■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 LRFN3Q9BTN0 628 aa21.39■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.39■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.39■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 ZBBXA8MT70 800 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 CTAGE5O15320 804 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 MCM2P49736 904 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 CCL23P55773 120 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 BEX3Q00994 111 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 ITGA7Q13683 1181 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 GNPTABQ3T906 1256 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 TMEM31Q5JXX7 168 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 ANO3Q9BYT9 981 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 COG5Q9UP83 839 aa21.38■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.37■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 ZEB2O60315 1214 aa21.37■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 NLRP5P59047 1200 aa21.37■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 ST3GAL1Q11201 340 aa21.37■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 GALNT17Q6IS24 598 aa21.37■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.37■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 PFKMP08237 780 aa21.36■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 MYOGP15173 224 aa21.36■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.36■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.36■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.36■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 RGS20O76081 388 aa21.35■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 ARIH2O95376 493 aa21.35■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 TGFB3P10600 412 aa21.35■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 SREBF1P36956 1147 aa21.35■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.35■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 AIFM3Q96NN9 605 aa21.35■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.35■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 EPHX3Q9H6B9 360 aa21.35■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.35■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.35■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.34■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.34■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 ALG1Q9BT22 464 aa21.34■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.34■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 TMEM260Q9NX78 707 aa21.34■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 FIBPO43427 364 aa21.33■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 B4GALT4O60513 344 aa21.33■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 JAK2O60674 1132 aa21.33■■□□□ 1.01
CTBP1-215ENST00000514596 GH1P01241 217 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms