RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503708.5

FGFR4-208, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 4

Gene FGFR4, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-208ENST00000503708 RSPH10BP0C881 870 aa21.58■■□□□ 1.05
FGFR4-208ENST00000503708 GNAT1P11488 350 aa21.58■■□□□ 1.05
FGFR4-208ENST00000503708 THPOP40225 353 aa21.58■■□□□ 1.05
FGFR4-208ENST00000503708 DEFB103AP81534 67 aa21.58■■□□□ 1.05
FGFR4-208ENST00000503708 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
FGFR4-208ENST00000503708 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.58■■□□□ 1.05
FGFR4-208ENST00000503708 METTL7BQ6UX53 244 aa21.58■■□□□ 1.05
FGFR4-208ENST00000503708 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.58■■□□□ 1.05
FGFR4-208ENST00000503708 LY9Q9HBG7 655 aa21.58■■□□□ 1.05
FGFR4-208ENST00000503708 PIK3CDO00329 1044 aa21.57■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 ARHGEF15O94989 841 aa21.57■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 LGALS2P05162 132 aa21.57■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 MCM5P33992 734 aa21.57■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.57■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.57■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 WNT8BQ93098 351 aa21.57■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 TMEM87BQ96K49 555 aa21.57■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.57■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.57■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 CCDC69A6NI79 296 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 PRC1O43663 620 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 CAND2O75155 1236 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 CALM1P0DP23 149 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 CALM2P0DP24 149 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 CALM3P0DP25 149 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 GRB10Q13322 594 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 HIC1Q14526 733 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 NLRX1Q86UT6 975 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 LCHNA4D1U4 455 aa21.55■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 AMHP03971 560 aa21.55■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 BMP1P13497 986 aa21.55■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 HOXC8P31273 242 aa21.55■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 MBTPS1Q14703 1052 aa21.55■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.55■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 GPR20Q99678 358 aa21.55■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.55■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 INSL6Q9Y581 213 aa21.55■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 TREHO43280 583 aa21.54■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 TFF2Q03403 129 aa21.54■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 TCTN1Q2MV58 587 aa21.54■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.54■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 HLA-CQ95604 372 aa21.54■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 CDHR1Q96JP9 859 aa21.54■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 MYL10Q9BUA6 226 aa21.54■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 PTPRSQ13332 1948 aa21.53■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 MEIS2O14770 477 aa21.53■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 LIFRP42702 1097 aa21.53■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 ERVK-21P61565 698 aa21.53■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 SEMA3FQ13275 785 aa21.53■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 KRT40Q6A162 431 aa21.53■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.53■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 SEPT8Q92599 483 aa21.53■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.53■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 LINC01553A4QN01 128 aa21.52■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 LPXNO60711 386 aa21.52■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.52■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 SETD4Q9NVD3 440 aa21.52■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.52■■□□□ 1.04
FGFR4-208ENST00000503708 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.51■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 GPRASP2Q96D09 838 aa21.51■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.51■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 NRCAMQ92823 1304 aa21.51■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 SLC27A2O14975 620 aa21.5■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.5■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 SPRED2Q7Z698 418 aa21.5■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.5■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.5■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.5■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 MAFGO15525 162 aa21.49■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 KCNQ1P51787 676 aa21.49■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 ARHGAP4P98171 946 aa21.49■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 SP4Q02446 784 aa21.49■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.49■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.49■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 FANCBQ8NB91 859 aa21.49■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 APBB2Q92870 758 aa21.49■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 KAT6AQ92794 2004 aa21.48■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.48■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 CTSHP09668 335 aa21.48■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 NECTIN1Q15223 517 aa21.48■■□□□ 1.03
FGFR4-208ENST00000503708 RNF20Q5VTR2 975 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms