RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC9A7	Q96T83	725 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	NOD1	Q9Y239	953 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TNKS	O95271	1327 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	MAN1A2	O60476	641 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	RELB	Q01201	579 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT40	Q6A162	431 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF135	Q8IUD6	432 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	MKL1	Q969V6	931 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	VTA1	Q9NP79	307 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511		Q9Y3F1	56 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	GNAT2	P19087	354 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	MCC	P23508	829 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	RFC2	P35250	354 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGIR	P43119	386 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ6	P48051	423 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CPT1A	P50416	773 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CHMP4BP1	P59074	171 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	SNAP25	P60880	206 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE4B	Q07343	736 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	MTMR7	Q9Y216	660 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	EPOP	A6NHQ4	379 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD1	Q719H9	257 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	APPBP2	Q92624	585 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	GPATCH3	Q96I76	525 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	STX8	Q9UNK0	236 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD50	Q92878	1312 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	TTLL8	A6PVC2	850 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	GPAA1	O43292	621 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	TFAP4	Q01664	338 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	TAP1	Q03518	808 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	GRB10	Q13322	594 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC96	Q2M329	555 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	OSBP2	Q969R2	916 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	GMCL1	Q96IK5	515 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF536	O15090	1300 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	MCM3AP	O60318	1980 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCF3	P0C7M6	154 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	BFSP2	Q13515	415 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	UIMC1	Q96RL1	719 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CRBN	Q96SW2	442 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	NAPB	Q9H115	298 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPY2	A6NKD2	308 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	BAIAP3	O94812	1187 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	USP4	Q13107	963 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R5B	Q15173	497 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
SKAP2-209	ENST00000497511	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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