RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496076.1

CLTC-208, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 2

Gene CLTC, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-208ENST00000496076 TESK1Q15569 626 aa7.3□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.3□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 MYOTQ9UBF9 498 aa7.3□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 SELENOPP49908 381 aa7.29□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.29□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.29□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.29□□□□□ -1.24
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CLTC-208ENST00000496076 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.28□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.28□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 GFRA1P56159 465 aa7.27□□□□□ -1.25
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CLTC-208ENST00000496076 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.27□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.27□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 Q8TCH9 128 aa7.27□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.27□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 NUDT11Q96G61 164 aa7.27□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.27□□□□□ -1.25
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CLTC-208ENST00000496076 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.27□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.27□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.27□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.27□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 COL6A1P12109 1028 aa7.26□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.26□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.26□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.26□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 B2RBV5 119 aa7.25□□□□□ -1.25
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CLTC-208ENST00000496076 PHF19Q5T6S3 580 aa7.25□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 PROSER1Q86XN7 944 aa7.25□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.25□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 CDIP1Q9H305 208 aa7.25□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.25□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 KRIT1O00522 736 aa7.24□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 KLHL18O94889 574 aa7.24□□□□□ -1.25
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CLTC-208ENST00000496076 KLF10Q13118 480 aa7.24□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 VASNQ6EMK4 673 aa7.24□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 JAM3Q9BX67 310 aa7.24□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.24□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.24□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.24□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.24□□□□□ -1.25
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CLTC-208ENST00000496076 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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CLTC-208ENST00000496076 Q6ZUG5 572 aa7.23□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 DTX3Q8N9I9 347 aa7.23□□□□□ -1.25
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CLTC-208ENST00000496076 C1orf159Q96HA4 380 aa7.23□□□□□ -1.25
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CLTC-208ENST00000496076 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.23□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.23□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 DLL4Q9NR61 685 aa7.23□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 SLC27A2O14975 620 aa7.22□□□□□ -1.25
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CLTC-208ENST00000496076 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.22□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.22□□□□□ -1.25
CLTC-208ENST00000496076 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.22□□□□□ -1.25
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CLTC-208ENST00000496076 KNG1P01042 644 aa7.21□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 HS1BP3Q53T59 392 aa7.21□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 CRB2Q5IJ48 1285 aa7.21□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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CLTC-208ENST00000496076 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.21□□□□□ -1.26
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CLTC-208ENST00000496076 FOXS1O43638 330 aa7.2□□□□□ -1.26
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CLTC-208ENST00000496076 CHGBP05060 677 aa7.2□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 CKMP06732 381 aa7.2□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 GRIA2P42262 883 aa7.2□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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CLTC-208ENST00000496076 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.2□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 MSCO60682 206 aa7.19□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 GLRBP48167 497 aa7.19□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 TNNI3KQ59H18 835 aa7.19□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.19□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 HOMEZQ8IX15 550 aa7.19□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.19□□□□□ -1.26
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CLTC-208ENST00000496076 GPR27Q9NS67 375 aa7.19□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.19□□□□□ -1.26
CLTC-208ENST00000496076 FAHP16930 419 aa7.18□□□□□ -1.26
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