RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 LCHNA4D1U4 455 aa26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 NOP56O00567 594 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 LGR5O75473 907 aa26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 LGALS2P05162 132 aa26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 GRB10Q13322 594 aa26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 METTL7BQ6UX53 244 aa26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF654Q8IZM8 581 aa26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 USP26Q9BXU7 913 aa26.04■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 FIBPO43427 364 aa26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 LPXNO60711 386 aa26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 TFF2Q03403 129 aa26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 CASC1Q6TDU7 716 aa26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP6V0A1Q93050 837 aa26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 COG5Q9UP83 839 aa26.03■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 RSPH10B2B2RC85 870 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 PIK3CDO00329 1044 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 RSPH10BP0C881 870 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 BMP1P13497 986 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 THPOP40225 353 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 SEMA3FQ13275 785 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 KRT40Q6A162 431 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 XRRA1Q6P2D8 792 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 SPRED2Q7Z698 418 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 CUL5Q93034 780 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 LZTS2Q9BRK4 669 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 LMCD1Q9NZU5 365 aa26.02■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 CAND2O75155 1236 aa26.01■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 PCNX4Q63HM2 1172 aa26.01■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 CYFIP1Q7L576 1253 aa26.01■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 NLRC5Q86WI3 1866 aa26.01■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.01■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 GNAQP50148 359 aa26■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 TMTC2Q8N394 836 aa26■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR20Q99678 358 aa26■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 SENP7Q9BQF6 1050 aa26■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 MYL10Q9BUA6 226 aa26■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 RNPEPQ9H4A4 650 aa26■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 MEIS2O14770 477 aa25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 PRC1O43663 620 aa25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 MCM5P33992 734 aa25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 ERVK-21P61565 698 aa25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 DBF4BQ8NFT6 615 aa25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM87BQ96K49 555 aa25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.99■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 LINC01553A4QN01 128 aa25.98■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 TREHO43280 583 aa25.98■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 GNAT1P11488 350 aa25.98■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 GDPD5Q8WTR4 605 aa25.98■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 INSL6Q9Y581 213 aa25.98■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 AMHP03971 560 aa25.97■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNQ1P51787 676 aa25.97■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 HLA-CQ95604 372 aa25.97■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.97■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC69A6NI79 296 aa25.96■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 CALM1P0DP23 149 aa25.96■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 CALM2P0DP24 149 aa25.96■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 CALM3P0DP25 149 aa25.96■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 LIFRP42702 1097 aa25.96■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.96■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 NLRX1Q86UT6 975 aa25.96■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.96■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.95■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.95■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 SEPT8Q92599 483 aa25.95■■□□□ 1.75
TRDMT1-211ENST00000495022 COL4A6Q14031 1691 aa25.95■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 ADAM17P78536 824 aa25.95■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM50Q86XT4 487 aa25.95■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.95■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 GPRASP2Q96D09 838 aa25.95■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 CDHR1Q96JP9 859 aa25.95■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.95■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 SETD4Q9NVD3 440 aa25.95■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 MTUS1Q9ULD2 1270 aa25.95■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 MYO7AQ13402 2215 aa25.94■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC27A2O14975 620 aa25.94■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 NRCAMQ92823 1304 aa25.93■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 CTSHP09668 335 aa25.93■■□□□ 1.74
TRDMT1-211ENST00000495022 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
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