RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 CSF2RAP15509 400 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 KCNA2P16389 499 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 SREBF1P36956 1147 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 PSEN2P49810 448 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 NEK4P51957 841 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 CCL23P55773 120 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 AP3B2Q13367 1082 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 MTMR1Q13613 665 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 MFSD10Q14728 455 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 MFSD5Q6N075 450 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 METTL7BQ6UX53 244 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 GPRASP2Q96D09 838 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 IL17RAQ96F46 866 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 GPR20Q99678 358 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 C6orf50Q9HD87 102 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.58□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 HAS3O00219 553 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 PFKFB2O60825 505 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 DEXIO95424 95 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 LARGE1O95461 756 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 LGALS2P05162 132 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 ARP10275 920 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 ACRP10323 421 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 GNA11P29992 359 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 ARHGAP4P98171 946 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 ANKRD1Q15327 319 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 PTGISQ16647 500 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 TRIM50Q86XT4 487 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 TMEM199Q8N511 208 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 C7orf31Q8N865 590 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 NECAB1Q8N987 351 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 SCLYQ96I15 445 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 CDHR1Q96JP9 859 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 AIFM3Q96NN9 605 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 NOD1Q9Y239 953 aa8.57□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 KAT6AQ92794 2004 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 FAM86B1E9PN63 330 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 H3BRB1 525 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 MEIS1O00470 390 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 CTDNEP1O95476 244 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 ZNF76P36508 570 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 NLRP5P59047 1200 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.045e-7■■■□□ 14.6
PATJ-211ENST00000493967 HIC1Q14526 733 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 ME3Q16798 604 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 CEP55Q53EZ4 464 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 SESTD1Q86VW0 696 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 UIMC1Q96RL1 719 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.56□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 DLL1O00548 723 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 MAFGO15525 162 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 CDKL5O76039 1030 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 CYP3A4P08684 503 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 TMEM240Q5SV17 173 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 MCTP2Q6DN12 878 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 ZNF365Q70YC5 407 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 TET1Q8NFU7 2136 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 BICD2Q8TD16 824 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.55□□□□□ -1.04
PATJ-211ENST00000493967 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
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