RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SMARCE1-211ENST00000493660 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.06□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 MOB2Q70IA6 237 aa8.06□□□□□ -1.12
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SMARCE1-211ENST00000493660 CYP3A7P24462 503 aa8.06□□□□□ -1.12
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SMARCE1-211ENST00000493660 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.06□□□□□ -1.12
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SMARCE1-211ENST00000493660 CYP3A4P08684 503 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMARCE1-211ENST00000493660 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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SMARCE1-211ENST00000493660 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 TRIM74Q86UV6 250 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 TRIM73Q86UV7 250 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 ENGASEQ8NFI3 743 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMARCE1-211ENST00000493660 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.05□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMARCE1-211ENST00000493660 CETPP11597 493 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 ALAS1P13196 640 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 PFKFB1P16118 471 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 GJA5P36382 358 aa8.04□□□□□ -1.12
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SMARCE1-211ENST00000493660 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 CHST13Q8NET6 341 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 DACT1Q9NYF0 836 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 PNMA3Q9UL41 463 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 RPTORQ8N122 1335 aa8.04□□□□□ -1.12
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SMARCE1-211ENST00000493660 SLC26A4O43511 780 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 EDIL3O43854 480 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 NR1I2O75469 434 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 ERLIN2O94905 339 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 CFBP00751 764 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 Q4G0T1 1027 aa8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SMARCE1-211ENST00000493660 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.04□□□□□ -1.12
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