RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 PANK4Q9NVE7 773 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.152e-7■■■■□ 25.7
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NELFE-211ENST00000492185 MFAP3LO75121 409 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 GYPCP04921 128 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 BCRP11274 1271 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 MUTP22033 750 aa22.23■■□□□ 1.15
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NELFE-211ENST00000492185 TRIM14Q14142 442 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 CEP135Q66GS9 1140 aa22.23■■□□□ 1.15
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NELFE-211ENST00000492185 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 CCDC51Q96ER9 411 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 CCP110O43303 1012 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 FLOT1O75955 427 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 PSMC6P62333 389 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 WDR90Q96KV7 1748 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 PICK1Q9NRD5 415 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 DNM3Q9UQ16 869 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 MB21D1Q8N884 522 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 REPS2Q8NFH8 660 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 C19orf81C9J6K1 198 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 PTPN14Q15678 1187 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 CNGA4Q8IV77 575 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 PTPRFP10586 1907 aa22.2■■□□□ 1.15
NELFE-211ENST00000492185 VWA5AO00534 786 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 ZBED4O75132 1171 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 EYA4O95677 639 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 DNM2P50570 870 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 UBXN1Q04323 297 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.2■■□□□ 1.14
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NELFE-211ENST00000492185 RIT2Q99578 217 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 ARP10275 920 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 ALAS1P13196 640 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 UBXN2AP68543 259 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 GIT2Q14161 759 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.19■■□□□ 1.14
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NELFE-211ENST00000492185 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 TUBB4AP04350 444 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 ITGB5P18084 799 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 CASP14P31944 242 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 MIIPQ5JXC2 388 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 SLITRK3O94933 977 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 UQCRHP07919 91 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 OAZ1P54368 228 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.142e-10■■■■□ 19.3
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NELFE-211ENST00000492185 ATG4CQ96DT6 458 aa22.18■■□□□ 1.14
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NELFE-211ENST00000492185 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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NELFE-211ENST00000492185 LRRC41Q15345 812 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 EPHA7Q15375 998 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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NELFE-211ENST00000492185 TPM1P09493 284 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-211ENST00000492185 DSG3P32926 999 aa22.17■■□□□ 1.14
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