RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490510.5

PITRM1-211, Transcript of pitrilysin metallopeptidase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITRM1, Length 778 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-211ENST00000490510 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.05■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.05■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 GPR20Q99678 358 aa22.05■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 H3BRB1 525 aa22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 BAIAP3O94812 1187 aa22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 CA3P07451 260 aa22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 UBE2SQ16763 222 aa22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 APOA5Q6Q788 366 aa22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 PPM1EQ8WY54 764 aa22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.04■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 ARHGEF15O94989 841 aa22.03■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 IGFBP4P22692 258 aa22.03■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 HOXC8P31273 242 aa22.03■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 MBTPS1Q14703 1052 aa22.03■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.03■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.03■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 ATP9AO75110 1047 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 SP4Q02446 784 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 NLRX1Q86UT6 975 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 SERINC5Q86VE9 423 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 TRIM50Q86XT4 487 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 USP26Q9BXU7 913 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.02■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 TREHO43280 583 aa22.01■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 ITGB5P18084 799 aa22.01■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 FUT2Q10981 343 aa22.01■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.01■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.01■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.01■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.01■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 ZBTB43O43298 467 aa22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 KCNA2P16389 499 aa22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 THPOP40225 353 aa22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 KCNJ6P48051 423 aa22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 DEFB103AP81534 67 aa22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 RTN1Q16799 776 aa22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 WWC2Q6AWC2 1192 aa22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 GPRASP2Q96D09 838 aa22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 CERS4Q9HA82 394 aa22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 EPOPA6NHQ4 379 aa21.99■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.99■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 KIF28PB7ZC32 967 aa21.99■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 RFXAPO00287 272 aa21.99■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 TAP1Q03518 808 aa21.99■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 SETD4Q9NVD3 440 aa21.99■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.98■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 RSPH10BP0C881 870 aa21.98■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 CPA1P15085 419 aa21.98■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 KRT32Q14532 448 aa21.98■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 SPRED2Q7Z698 418 aa21.98■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 KCNB2Q92953 911 aa21.98■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 PTPRSQ13332 1948 aa21.98■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.97■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.97■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 LCHNA4D1U4 455 aa21.97■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 TLL1O43897 1013 aa21.97■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 LGR5O75473 907 aa21.97■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 CDC27P30260 824 aa21.97■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 CDHR1Q96JP9 859 aa21.97■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 JADE2Q9NQC1 790 aa21.97■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.97■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.96■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.96■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.96■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 NAPAP54920 295 aa21.96■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 ADAM17P78536 824 aa21.96■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 MTMR1Q13613 665 aa21.96■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 IKBKEQ14164 716 aa21.96■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.96■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.96■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 PGBD1Q96JS3 809 aa21.96■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.96■■□□□ 1.11
PITRM1-211ENST00000490510 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms