RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487577.5

TYMP-208, Transcript of thymidine phosphorylase, human

TSL 1 (best)

Gene TYMP, Length 1,751 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TYMP-208	ENST00000487577	STIM1	Q13586	685 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TYMP-208	ENST00000487577	MTMR1	Q13613	665 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TYMP-208	ENST00000487577	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TYMP-208	ENST00000487577	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TYMP-208	ENST00000487577	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TYMP-208	ENST00000487577	MED15	Q96RN5	788 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TYMP-208	ENST00000487577	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TYMP-208	ENST00000487577	DNM3	Q9UQ16	869 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TYMP-208	ENST00000487577	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	ATP1A3	P13637	1013 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	OSBP	P22059	807 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	CCND2	P30279	289 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	HERVK_113	P62684	666 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	FANCC	Q00597	558 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	CYP4A11	Q02928	519 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	PAK1	Q13153	545 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	SPATA1	Q5VX52	437 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	UNC13D	Q70J99	1090 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	DDX12P	Q92771	950 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	FBXO40	Q9UH90	709 aa		27.58	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	GJA5	P36382	358 aa		27.57	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	PRCP	P42785	496 aa		27.57	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	MOGS	Q13724	837 aa		27.57	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		27.57	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		27.57	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		27.57	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	IFNK	Q9P0W0	207 aa		27.57	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		27.57	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		27.57	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	SERPINC1	P01008	464 aa		27.56	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	FKBP1B	P68106	108 aa		27.56	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	ADSSL1	Q8N142	457 aa		27.56	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		27.56	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	NELFB	Q8WX92	580 aa		27.56	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		27.56	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		27.56	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	PEX10	O60683	326 aa		27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	NR3C2	P08235	984 aa		27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	IDE	P14735	1019 aa		27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	RGL1	Q9NZL6	768 aa		27.55	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	EPHA7	Q15375	998 aa		27.54	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		27.54	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	GPBP1	Q86WP2	473 aa		27.54	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		27.54	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	DYDC2	Q96IM9	177 aa		27.54	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	PFAS	O15067	1338 aa		27.54	■■■□□ 2
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TYMP-208	ENST00000487577	ZNF18	P17022	549 aa		27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	PSMC6	P62333	389 aa		27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	TPH2	Q8IWU9	490 aa		27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	PSMA7	O14818	248 aa		27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	PPP1R2	P41236	205 aa		27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	SLC12A3	P55017	1021 aa		27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	STK4	Q13043	487 aa		27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	NLRX1	Q86UT6	975 aa		27.53	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	SLITRK3	O94933	977 aa		27.52	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	TPM3	P06753	285 aa		27.52	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	FCER1A	P12319	257 aa		27.52	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	UBASH3A	P57075	661 aa		27.52	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		27.52	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		27.52	■■■□□ 2
TYMP-208	ENST00000487577	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
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TYMP-208	ENST00000487577	CYP11B2	P19099	503 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	MUT	P22033	750 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	GPRASP2	Q96D09	838 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	COBL	O75128	1261 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	EYA4	O95677	639 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	SLC25A27	O95847	323 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	PSMD2	Q13200	908 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	NEK9	Q8TD19	979 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	PANK4	Q9NVE7	773 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	PNMA3	Q9UL41	463 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TYMP-208	ENST00000487577	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		27.5	■■□□□ 1.99

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