RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486199.5

PHF20L1-215, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, humanhuman

TSL 2

Gene PHF20L1, Length 1,633 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20L1-215ENST00000486199 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 BAG2O95816 211 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 ITGA6P23229 1130 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 PSMA3P25788 255 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 SCAND1P57086 179 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 ANO4Q32M45 955 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 FAM13CQ8NE31 585 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 KIAA1191Q96A73 305 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 GMCL1Q96IK5 515 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 APOL5Q9BWW9 433 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 BRD9Q9H8M2 597 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 MARK1Q9P0L2 795 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 CD109Q6YHK3 1445 aa6.9□□□□□ -1.3
PHF20L1-215ENST00000486199 FAM177BA6PVY3 158 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 RGS13O14921 159 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 ADAMTS3O15072 1205 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 HMMRO75330 724 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 HOXC12P31275 282 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 GALNSP34059 522 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 CAP2P40123 477 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 RNF220Q5VTB9 566 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 BROXQ5VW32 411 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 USP53Q70EK8 1073 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 NBPF11Q86T75 865 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 TMEM192Q8IY95 271 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 ITPKCQ96DU7 683 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 KRT82Q9NSB4 513 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 ABCF2Q9UG63 623 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 CUL7Q14999 1698 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 SMTNL1A8MU46 457 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 ARVCFO00192 962 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 TRAF5O00463 557 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 B3GALT2O43825 422 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 POU2F2P09086 479 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 FAM157BP0CG42 384 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 ITGA4P13612 1032 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 KCNA6P17658 529 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 SCP2P22307 547 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 ARL4CP56559 192 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 PRKG1Q13976 671 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 STARD3Q14849 445 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 TMEM177Q53S58 311 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 LCA5Q86VQ0 697 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 PANK1Q8TE04 598 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 MVB12AQ96EY5 273 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 TMEM169Q96HH4 297 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 SOX13Q9UN79 622 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 L1RE1Q9UN81 338 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 DISP1Q96F81 1524 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 IQGAP2Q13576 1575 aa6.89□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.88□□□□□ -1.31
PHF20L1-215ENST00000486199 CAPN8A6NHC0 703 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms