RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482716.5

CNNM4-202, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 4, humanhuman

TSL 3

Gene CNNM4, Length 547 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4-202ENST00000482716 COPS5Q92905 334 aa13.54□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 KAT14Q9H8E8 782 aa13.54□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa13.54□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 TRPC6Q9Y210 931 aa13.54□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 MTMR7Q9Y216 660 aa13.54□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 NOD1Q9Y239 953 aa13.54□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 PROB1E7EW31 1015 aa13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 CSPG5O95196 566 aa13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 AVPR2P30518 371 aa13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 LIFRP42702 1097 aa13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 HYAL1Q12794 435 aa13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 PTGISQ16647 500 aa13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 Q6ZUG5 572 aa13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 LRRC8DQ7L1W4 858 aa13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 TMTC2Q8N394 836 aa13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 ASIC4Q96FT7 647 aa13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 WDR11Q9BZH6 1224 aa13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 PDRG1Q9NUG6 133 aa13.53□□□□□ -0.24
CNNM4-202ENST00000482716 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 H3BNC9 293 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 SELPP16109 830 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 CPT1AP50416 773 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 NEK4P51957 841 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 FGD1P98174 961 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 MBTPS1Q14703 1052 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 NFXL1Q6ZNB6 911 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 RASGRP2Q7LDG7 609 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 PNMA1Q8ND90 353 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 AFAP1L1Q8TED9 768 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 WNT8BQ93098 351 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 VTA1Q9NP79 307 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 INSL6Q9Y581 213 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 NCOR2Q9Y618 2525 aa13.52□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 CCDC69A6NI79 296 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 LGR5O75473 907 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 CKBP12277 381 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 ALAS1P13196 640 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 OAZ1P54368 228 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 PKN1Q16512 942 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 TRAF7Q6Q0C0 670 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 SGMS1Q86VZ5 419 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 MYOCDQ8IZQ8 938 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 FBXL16Q8N461 479 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 BRF1Q92994 677 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 GMCL1Q96IK5 515 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 TRERF1Q96PN7 1200 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 FEM1BQ9UK73 627 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 BRPF3Q9ULD4 1205 aa13.51□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 ZNF292O60281 2723 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 PDHBP11177 359 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 BMP3P12645 472 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 SLC1A4P43007 532 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 APOBRQ0VD83 1088 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 IKBKEQ14164 716 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 RABEP1Q15276 862 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 CCDC96Q2M329 555 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 CATIPQ7Z7H3 387 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 TMEM192Q8IY95 271 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 ZNF654Q8IZM8 581 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 CAGE1Q8TC20 777 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 MORC4Q8TE76 937 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 DCAF4Q8WV16 495 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 MYL10Q9BUA6 226 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 AGXT2Q9BYV1 514 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 IGFLR1Q9H665 355 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 GPCPD1Q9NPB8 672 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 SLC12A7Q9Y666 1083 aa13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa13.49□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 SNHG28P0DPA3 235 aa13.49□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 TROAPQ12815 778 aa13.49□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 TTBK2Q6IQ55 1244 aa13.49□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 NSMFQ6X4W1 530 aa13.49□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 KCTD1Q719H9 257 aa13.49□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 LOC730098B7Z3J9 87 aa13.48□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 TMEM232C9JQI7 657 aa13.48□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 GRM6O15303 877 aa13.48□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 DDAH1O94760 285 aa13.48□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 GOLGA8HP0CJ92 632 aa13.48□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 RXRAP19793 462 aa13.48□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 AK2P54819 239 aa13.48□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 ZNF543Q08ER8 600 aa13.48□□□□□ -0.25
CNNM4-202ENST00000482716 SIGLEC14Q08ET2 396 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms