RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482096.1

UBE2F-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative), human

TSL 4

Gene UBE2F, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2F-222	ENST00000482096	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	MAF1	Q9H063	256 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	RFXAP	O00287	272 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	GGCX	P38435	758 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	TFF2	Q03403	129 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	TAP1	Q03518	808 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	MCM6	Q14566	821 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	AAK1	Q2M2I8	961 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	DGKH	Q86XP1	1220 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	NCOR1	O75376	2440 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	EPOP	A6NHQ4	379 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	KIF28P	B7ZC32	967 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	BAIAP3	O94812	1187 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	ARHGEF15	O94989	841 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	GH1	P01241	217 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	NT5C2	P49902	561 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	GPNMB	Q14956	572 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	PTGIS	Q16647	500 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	USH1G	Q495M9	461 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	SESTD1	Q86VW0	696 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CAGE1	Q8TC20	777 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	AFG1L	Q8WV93	481 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	TBC1D5	Q92609	795 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	ESR2	Q92731	530 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CERS4	Q9HA82	394 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	MAP10	Q9P2G4	905 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	NOD1	Q9Y239	953 aa		10.05	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	GBF1	Q92538	1859 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	MMP3	P08254	477 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	KCNQ1	P51787	676 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	ARHGAP1	Q07960	439 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	RBL2	Q08999	1139 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	LY6K	Q17RY6	165 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	ANKS1A	Q92625	1134 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	KAT2B	Q92831	832 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	IWS1	Q96ST2	819 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CPVL	Q9H3G5	476 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	COL20A1	Q9P218	1284 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	COG5	Q9UP83	839 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	ABCB11	O95342	1321 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	NEDD4	P46934	1319 aa		10.04	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF213	O14771	459 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	LPXN	O60711	386 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CXCL10	P02778	98 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	SELP	P16109	830 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CTH	P32929	405 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	CHMP4BP1	P59074	171 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	GRB10	Q13322	594 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	STXBP2	Q15833	593 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	KRT40	Q6A162	431 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	IQCA1	Q86XH1	822 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	RMDN3	Q96TC7	470 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		10.03	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	SCN5A	Q14524	2016 aa		10.02	□□□□□ -0.8
UBE2F-222	ENST00000482096	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	SDS	P20132	328 aa		10.02	□□□□□ -0.81
UBE2F-222	ENST00000482096	KCNJ6	P48051	423 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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