RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 TTLL6Q8N841 843 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 BAP1Q92560 729 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 UBXN4Q92575 508 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SLC5A5Q92911 643 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CSRNP1Q96S65 589 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 TSG101Q99816 390 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 DESI2Q9BSY9 194 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 NDST4Q9H3R1 872 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 VCPKMTQ9H867 229 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 OLFML3Q9NRN5 406 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 RAB21Q9UL25 225 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MYO6Q9UM54 1294 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MTMR7Q9Y216 660 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 RPTORQ8N122 1335 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 DOCK1Q14185 1865 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CCDC151A5D8V7 595 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 B4DLN1 442 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 USP17L15C9J2P7 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 USP17L11C9JVI0 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 USP17L18D6R9N7 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 USP17L22D6RA61 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 USP17L19D6RCP7 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 USP17L20D6RJB6 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FAM86B1E9PN63 330 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PDXKO00764 312 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MSH4O15457 936 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MED24O75448 989 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PSMD10O75832 226 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 EYA4O95677 639 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FAM86B2P0C5J1 330 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PRLRP16471 622 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PTGER2P43116 358 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 VAV2P52735 878 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF131P52739 623 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CACNB3P54284 484 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 HERVK_113P62684 666 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SETQ01105 290 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 USP17L24Q0WX57 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ARSHQ5FYA8 562 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 NEK9Q8TD19 979 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CHP1Q99653 195 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CARD6Q9BX69 1037 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 GOPCQ9HD26 462 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 EP400Q96L91 3159 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 RLFQ13129 1914 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SMCHD1A6NHR9 2005 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 POTEB3A0JP26 581 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CTAGE9A4FU28 777 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FAM196BA6NMK8 535 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 POTECB2RU33 542 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 KRT86O43790 486 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 LYPLA2O95372 231 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 GDF11O95390 407 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ASNSP08243 561 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FDX1P10109 184 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 GAP43P17677 238 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 RPS12P25398 132 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CAP2P40123 477 aa7.22□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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